ISBN online: 978-80-244-6049-9 | DOI: 10.5507/lf.22.24460499

Laboratory Techniques in Cellular and Molecular Medicine

Khushboo Agrawal (Ed.), Jan Bouchal (Ed.), Viswanath Das (Ed.), Jiří Drábek (Ed.), Petr Džubák (Ed.), Marián Hajdúch (Ed.), Karel Koberna (Ed.), Anna Ligasová (Ed.), Martin Mistrík (Ed.), Juan Batista de Sanctis (Ed.), Josef Srovnal Ed.), Anna Janošťáková (A.), Viswanath Das (A.), Natálie Kudlová (A.), Jana Stránská (A.), Renata Buriánová (A.), Jana Kotulová (A.), Ermin Schadich (A.), Martin Ondra (A.), Agáta Kubíčková (A.), Soňa Gurská (A.), Pavla Flodrová (A.), Patrik Flodr (A.), Daniela Kurfürstová (A.), Gabriela Kořínková (A.), Mariam Gachechiladze (A.), Tereza Buchtová (A.), Martin Mistrík (A.), Radek Trojanec (A.), Zuzana Šporiková (A.), Jiří Řehulka (A.), Anna Ligasová (A.), Karel Koberna (A.), Jarmila Stanková (A.), Ivo Frydrych (A.), Khushboo Agrawal (A.), Matthew Lacey (A.), Zdeněk Škrott (A.), Vlastimil Mašek (A.), Martina Medvedíková (A.), Ján Gurský (A.), Petr Džubák (A.), Juan B. De Sanctis (A.), Lenka Hrubá (A.), Jana Václavková (A.), Dušan Holub (A.), Tomáš Oždian (A.), Martina Jakoubková (A.), Miloš Petřík (A.), Zbyněk Nový (A.), Narendran Annadurai (A.), Alejandro Carazo (A.), Barbora Lišková (A.), Vladimíra Koudeláková (A.), Vaishali Uniyal (A.), Jiří Drábek (A.), Zuzana Macečková (A.), Hanuš Slavík (A.), Josef Srovnal (A.), Alona Řehulková (A.), Karolína Bartáková (A.), Rastislav Slavkovský (A.)


Metodická kniha „Laboratory techniques in cellular and molecular medicine“ je určena studentům bakalářských, magisterských a doktorandských studijních programů přírodovědeckých, lékařských a veterinárních fakult a laboratorním pracovníkům, kteří se zajímají o metodické přístupy současné buněčné a molekulární medicíny. Kniha si neklade za cíl poskytnout celkový přehled o současném stavu v oblasti buněčné a molekulární medicíny – to by byl nadlidský úkol. Cílem 56členného autorského kolektivu je poskytnout čtenářům přehled metod, zavedených a ozkoušených v Ústavu molekulární a translační medicíny Lékařské fakulty Univerzity Palackého, popsat metodické principy a jejich praktickou aplikaci. Zaměřuje se jednak na metody základní, jejichž principy využívají i ty nejmodernější metody, jednak na metody speciální, odrážející laboratorní zkušenosti a specializaci jednotlivých autorů. V 52 kapitolách je popsána práce s buňkami a mikroorganismy, bioinženýrské manipulace s nukleovými kyselinami, hledání biomarkerů, detekce na úrovni DNA, RNA, proteinu, organely i celé buňky, využití fluorescenčního i radioaktivního značení. Pro zvýšení názornosti je popis metod opatřen obrázky a schématy. Za každou kapitolou jsou tipy na řešení případných problémů. Kniha propaguje nejlepší laboratorní praxi pro zvýšení reprodukovatelnosti výsledků v biomedicíně.

1. vydání, online: 2022, vydavatel: Univerzita Palackého v Olomouci, Křížkovského 8, 771 47 Olomouc



Reference

  1. GERAGHTY, R. J., A. CAPES-DAVIS, J. M. DAVIS, J. DOWNWARD, R. I. FRESHNEY, I. KNEZEVIC, R. LOVELL-BADGE, J. R. W. MASTERS, J. MEREDITH, G. N. STACEY, P. THRAVES, and M. VIAS. Guidelines for the use of cell lines in biomedical research. British Journal of Cancer. 2014; 111(6):1021-1046. Přejít k původnímu zdroji...
  2. FRESHNEY, R. I. Culture of Animal Cells. A manual of basic techniques. 5th. ed. New Jersey: John Wiley and Sons, Inc.; 2005. ISBN: 9780471453291. Přejít k původnímu zdroji...
  3. ARORA, M. Cell Culture Media: A Review. Mater Methods. 2013; 3:175. Přejít k původnímu zdroji...
  4. CAPES-DAVIS, A., G. THEODOSOPOULOS, I. ATKIN, H. G. DREXLER, A. KOHARA, R. A. F. MACLEOD, J. R. MASTERS, Y. NAKAMURA, Y. A. REID, R. R. REDDEL, and R. I. FRESHNEY. Check your cultures! A list of cross-contaminated or misidentified cell lines. International Journal of Cancer. 2010; 127(1):1-8. Přejít k původnímu zdroji...
  5. DAS, V., F. BRUZZESE, P. KONEČNÝ, F., IANNELLI, A. BUDILLON, and M. HAJDÚCH. Pathophysiologically relevant in vitro tumor models for drug screening. Drug Discovery Today. 2015, 20(12):848-55. Přejít k původnímu zdroji...
  6. LABARBERA, D.V., B. G. REID, and B. H. YOO. The multicellular tumor spheroid model for high-throughput cancer drug discovery. Expert Opinion on Drug Discovery. 2012, 7(9):819-30. Přejít k původnímu zdroji...
  7. FRIEDRICH, J., C. SEIDEL, R. EBNER, and L. A. KUNZ-SCHUGHART. Spheroid-based drug screen: considerations and practical approach. Nature Protocols. 2009, 4(3):309-24. Přejít k původnímu zdroji...
  8. KENNY, H.A., M. LAL-NAG, E. A. WHITE, M. SHEN, C. Y. CHIANG, A. K. MITRA, Y. ZHANG, M. CURTIS, E. M. SCHRYVER, S. BETTIS, A. JADHAV, M. B. BOXER, Z. LI, M. FERRER, and E. LENGYEL. Quantitative high throughput screening using a primary human three-dimensional organotypic culture predicts in vivo efficacy. Nature Communications. 2015, 6:6220. Přejít k původnímu zdroji...
  9. MONJARET, F., M. FERNANDES, E. DUCHEMIN-PELLETIER, A. ARGENTO, S. DEGOT, and J. YOUNG. Fully Automated One-Step Production of Functional 3D Tumor Spheroids for High-Content Screening. Journal of Laboratory Automation. 2015, 21(2):268-80. Přejít k původnímu zdroji...
  10. LAO, Z., C. J. KELLY, X. Y. YANG, W. T. JENKINS, E. TOORENS, T. GANGULY, S. M. EVANS, and C. J. KOCH. Improved Methods to Generate Spheroid Cultures from Tumor Cells, Tumor Cells & Fibroblasts or Tumor-Fragments: Microenvironment, Microvesicles and MiRNA. PLoS One. 2015, 10(7):e0133895. Přejít k původnímu zdroji...
  11. WENZEL, C., B. RIEFKE, S. GRÜNDEMANN, A. KREBS, S. CHRISTIAN, F. PRINZ, M. OSTERLAND, S. GOLFIER, S. RÄSE, N. ANSARI, M. ESNER, M. BICKLE, F. PAMPALONI, C. MATTHEYER, E. H. STELZER, K. PARCZYK, S. PRECHTL, and P. STEIGEMANN. 3D high-content screening for the identification of compounds that target cells in dormant tumor spheroid regions. Experimental Cell Research. 2014, 323(1):131-43. Přejít k původnímu zdroji...
  12. LI, Q., C. CHEN, A. KAPADIA, Q. ZHOU, M. K. HARPER, J. SCHAACK, and D. V. LABARBERA. 3D Models of Epithelial-Mesenchymal Transition in Breast Cancer Metastasis: High-Throughput Screening Assay Development, Validation, and Pilot Screen. Journal of Bimolecular Screening. 2011, 16(2):141-54. Přejít k původnímu zdroji...
  13. BERG, M., K. UNDISZ, R. THIERICKE, P. ZIMMERMANN, T. MOORE, and C. POSTEN. Evaluation of Liquid Handling Conditions in Microplates. Journal of Bimolecular Screening. 2001, 6(1):47-56. Přejít k původnímu zdroji...
  14. BERTHIER, E., J. WARRICK, H. YU, and D. J. BEEBE. Managing evaporation for more robust microscale assays Part 1. Volume loss in high throughput assays. Lab Chip. 2008, 8(6):852-9. Přejít k původnímu zdroji...
  15. WALZL, A., N. KRAMER, G. MAZZA, M. ROSNER, D. FALKENHAGEN, M. HENGSTSCHLÄGER, D. SCHWANZER-PFEIFFER, and H. DOLZNIG. A Simple and Cost Efficient Method to Avoid Unequal Evaporation in Cellular Screening Assays, Which Restores Cellular Metabolic Activity. International Journal of Applied Science and Technology. 2012, 2(6):17-25.
  16. PATEL, M.I., R. TUCKERMAN, and Q. DONG. A Pitfall of the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-5(3-carboxymethonyphenol)-2-(4-sulfophenyl)-2H-tetrazolium (MTS) Assay due to Evaporation in wells on the Edge of a 96 well Plate. Biotechnology Letters. 2005, 27(11):805-8. Přejít k původnímu zdroji...
  17. HEO, Y.S., L. M. CABRERA, J. W. SONG, N. FUTAI, Y. C. TUNG, G. D. SMITH, and S. TAKAYAMA. Characterization and Resolution of Evaporation-Mediated Osmolality Shifts That Constrain Microfluidic Cell Culture in Poly(dimethylsiloxane) Devices. Analytical Chemistry. 2007, 79(3):1126-34. Přejít k původnímu zdroji...
  18. FAESSEL, H.M., L. M. LEVASSEUR, H. K. SLOCUM, and W. R. GRECO. Parabolic growth patterns in 96-well plate cell growth experiments. In Vitro Cellular & Developmental Biology - Animal. 1999, 35(5):270-8. Přejít k původnímu zdroji...
  19. DAS, V., T. FÜRST, S. GURSKÁ, P. DŽUBÁK, and M. HAJDÚCH. Reproducibility of Uniform Spheroid Formation in 384-Well Plates: The Effect of Medium Evaporation. Journal of Bimolecular Screening. 2016, 21(9):923-30. Přejít k původnímu zdroji...
  20. DAS, V., T. FÜRST, S. GURSKÁ, P. DŽUBÁK, and M. HAJDÚCH. Evaporation-reducing Culture Condition Increases the Reproducibility of Multicellular Spheroid Formation in Microtiter Plates. Journal of Visualized Experiments. 2017, 2017 (121):e55403. Přejít k původnímu zdroji...
  21. ZANONI, M., F. PICCININI, C. ARIENTI, A. ZAMAGNI, S. SANTI, R. POLICO, A. BEVILACQUA, and A. TESEI, A. 3D tumor spheroid models for in vitro therapeutic screening: a systematic approach to enhance the biological relevance of data obtained. Scientific Reports. 2016, 6:19103. Přejít k původnímu zdroji...
  22. ZIMMERMANN, H.F., G. T. JOHN, H. TRAUTHWEIN, U. DINGERDISSEN, and K. HUTHMACHER. Rapid Evaluation of Oxygen and Water Permeation through Microplate Sealing Tapes. Biotechnology Progress. 2003, 19(3):1061-3. Přejít k původnímu zdroji...
  23. WICKRAMASINGHE, S. N. Culture of animal cells. A manual of basic technique. 3rd. R. Ian Freshney, Wiley-Liss;1994. ISSN:02636484.
  24. STROBER, W. Trypan Blue Exclusion Test of Cell Viability. Current Protocols in Immunology. 2001; Appendix 3, p. Appendix 3B. Přejít k původnímu zdroji...
  25. DAVIS, J.D. The hemocytometer and its impact on Progressive Era medicine. 1995.
  26. VERSO, M L. Some nineteenth-century pioneers of haematology. Medical history. 1971; 15(1):55-67. Přejít k původnímu zdroji...
  27. Anon. Counting Cells with a Hemacytometer. [online]. Available also from WWW:
  28. WILLÉN, E. A simplified method of phytoplankton counting. British Phycological Journal. 1976; 11(3):265-278. Přejít k původnímu zdroji...
  29. CHATTERJEE, R. Cases of mistaken identity. Science, 2007, 315(5814), 928-931. Přejít k původnímu zdroji...
  30. CLEMENT, V., D. MARINO., C. CUDALBU, M. F. HAMOU, V. MLYNARIK, N. DE TRIBOLET, P. Y. DIETRICH, R. GRUETTER, M. E. HEGI, and I RADOVANOVIC. RETRACTED: marker-independent identification of glioma-initiating cells (retracted article. See vol. 10, pg. 1035, 2013). Nature Methods, 2010, 7(3), 224-U88. Přejít k původnímu zdroji...
  31. MARX, V. Cell-line authentication demystified. Nature Methods, 2014, 11(5), 483-8. Přejít k původnímu zdroji...
  32. PowerPlex® 18D System for Use on the Applied Biosystems® Genetic Analyzers, Technical Manual
  33. GeneMarker® HID, Quick Start Guide
  34. GeneMarker® HID, User Manual
  35. SHANNON, M., A. CAPES-DAVIS, E. EGGINGTON, R. GEORGHIOU, L.I. HUSCHTSCHA, E. MOY, M. POWER, R.R. REDDEL, and J.W. ARTHUR. Is cell culture a risky business? Risk analysis based on scientist survey data. International Journal of Cancer. 2016;138(3):664-70. Přejít k původnímu zdroji...
  36. CORRAL-VÁZQUEZ, C., R. AGUILAR-QUESADA, P. CATALINA, G. LUCENA-AGUILAR, G. LIGERO, B. MIRANDA,, and J.A. CARRILLO-ÁVILA. Cell lines authentication and Mycoplasma detection as minimum quality control of cell lines in biobanking. Cell and Tissue Banking. 2017;18(2):271-80. Přejít k původnímu zdroji...
  37. BROWNING, G.F. and C. CITTI. Mollicutes: Molecular biology and pathogenesis. 1st ed. Norfolk, UK: Caister Academic Press; 2014. ISBN:9781908230300.
  38. BASEMAN, J.B. and J.G. TULLY. Mycoplasmas: sophisticated, reemerging, and burdened by their notoriety. Emerging Infectious Diseases. 1997;3(1):21-32. Přejít k původnímu zdroji...
  39. LO, S.-C., M.M. HAYES, J. G.TULLY, G. R.Y.-H. WAN, H. KOTANI, P.F. PIERCE, and D.L.ROSE, J.W. SHIH. Mycoplasma penetrans sp. nov., from the urogenital tract of patients with AIDS. International Journal of Systematic Bacteriology. 1992;42(3):357-64. Přejít k původnímu zdroji...
  40. DREXLER, H.G. and C. C. UPHOFF. Mycoplasma contamination of cell cultures: Incidence, sources, effects, detection, elimination, prevention. Cytotechnology. 2002;39(2):75-90. Přejít k původnímu zdroji...
  41. ROTTEM, S. and M. F. BARILE. Beware of mycoplasmas. Trends in Biotechnology 1993;11(4):143-51. Přejít k původnímu zdroji...
  42. UPHOFF, C.C., and H. G. DREXLER. Detection of Mycoplasma contaminations. Methods in Molecular Biology. 2013;946:1-13. Přejít k původnímu zdroji...
  43. FOGH, J., N. HOLMGREB, and P. LUDOVICI. A Review of Cell Culture Contaminations. In Vitro. 1971; 7(1):6-41. Přejít k původnímu zdroji...
  44. COBO, J. CORTES, C. CABREERA, A. NIETO, and A. CONCHA. Microbiological Contamination in Stem Cell Cultures. Cell Biology International. 2007; 31(9):991-995. Přejít k původnímu zdroji...
  45. FRESHNEY, R. Contamination. In: Culture of Animal Cells: A Manual of Basic Technique and Specialized Applications. New York; Wiley; 2010. pp. 299-315. ISBN: 9780470528129 Přejít k původnímu zdroji...
  46. LANGDON, S. Cell Culture Contamination: An Overview. Methods in Molecular Medicine. 2004; 88:309-317. Přejít k původnímu zdroji...
  47. MERTEN S. Virus Contaminations of Cell Cultures - A Biotechnological View. Cytotechnology. 2002; 39(2):91-116. Přejít k původnímu zdroji...
  48. LICNOLN, C. and M. GABRDIGE. Cell Culture Contamination: Sources, Consequences, Prevention and Elimination. Methods in Cell Biology. 1998; 57:49-65. Přejít k původnímu zdroji...
  49. MAHMOOD, A. and S. ALI. Microbial and Viral Contamination of Animal and Stem Cell Cultures: Common Contaminants, Detection and Elimination. Journal of Stem Cell Research & Therapeutics. 2017; 2(5):149-155. Přejít k původnímu zdroji...
  50. MIRJALILI, A., E. PARMOOR, S. MORADI BIDHENDI, and B. SARKARI. Microbial Contamination of Cell Cultures: a 2 years study. Biologicals. 2005; 33(2): 81-85. Přejít k původnímu zdroji...
  51. UPHOFF, C. and H. DREXELER. Detection of Mycoplasma Contamination in Cell Cultures. Current Protocols in Molecular Biology. 2014; 106(28):1-14. Přejít k původnímu zdroji...
  52. STACEY, G. Cell culture contamination. Methods in Molecular Biology. 2011; 731:79-91. Přejít k původnímu zdroji...
  53. VIERCK, J., K. BYRNE, P. MIR, and M. DODSON. Ten commandments for preventing contamination of primary cell cultures. Methods in Cell Science. 2000; 22(1):33-41. Přejít k původnímu zdroji...
  54. PHELAN, M. Techniques for mammalian cell tissue culture. Current Protocols in Cytometry. 2006; 36 (1):1-18. Přejít k původnímu zdroji...
  55. UPHOFF, C., and H. DREXELER. Eradication of Mycoplasma contaminations from cell cultures. Current Protocols in Molecular Biology. 2014; 106(28):1-12. Přejít k původnímu zdroji...
  56. NAKAI, N., C. KAWAGUCHI, K. NAWA, S. KOBAYASHI, Y. KATSUTA, and M. WATANABE. Detection and elimination of contaminating microorganisms in transplantable tumors and cell lines. Experimental Animals. 2000; 49(4):309-313. Přejít k původnímu zdroji...
  57. MACLEOD, K. and S. LANGDON. Essential techniques of cancer cell culture. Methods in Molecular Medicine. 2004: 88:17-29. Přejít k původnímu zdroji...
  58. LI, A, Z. SUN and M. REETZ. Solid-Phase Gene Synthesis for Mutant Library Construction: The Future of Directed Evolution? ChemBioChem. 2018; 19(19):2023-2032. Přejít k původnímu zdroji...
  59. JOHNSTON, C., B. MARTIN, G. FICHANT, P. POLARD, and J. CLAVERYS. Bacterial transformation: distribution, shared mechanisms and divergent control. Nature Reviews Microbiology. 2014; 12(3):181-196. Přejít k původnímu zdroji...
  60. BENNETT, P. Plasmid encoded antibiotic resistance: acquisition and transfer of antibiotic resistance genes in bacteria. British Journal of Pharmacology. 2009; 153(S1): S347-S357. Přejít k původnímu zdroji...
  61. HANAHAN, D. Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids. Journal of Molecular Biology. 1983; 166(4):557-580. Přejít k původnímu zdroji...
  62. HANAHAN, D. Techniques for transformation of E. coli. In: Glover D M, editor. DNA cloning: a practical approach. Vol. 1. Oxford, United Kingdom: IRL Press; 1985. pp. 109-135.
  63. MANDEL, M. and A. HIGA. Calcium-dependent bacteriophage DNA infection. Journal of Molecular Biology. 1970; 53(1):159-162. Přejít k původnímu zdroji...
  64. FROGER, A. and J. HALL. Transformation of Plasmid DNA into E. coli Using the Heat Shock Method. Journal of Visualized Experiments. 2007; (6):e253. Přejít k původnímu zdroji...
  65. DOWER, W, J. MILLER, and C. RAGSDALE. High efficiency transformation of E. coli by high voltage electroporation. Nucleic Acids Research. 1988; 16(13):6127-6145. Přejít k původnímu zdroji...
  66. KAESTNER, L., A. SCHOLZ, and P. LIPP. Conceptual and technical aspects of transfection and gene delivery. Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. 2015, 25(6), 1171-1176. Přejít k původnímu zdroji...
  67. MARCOS-VADILLO, E. and A. GARCIA-SANCHEZ. Protocol for Lipid-Mediated Transient Transfection in A549 Epithelial Lung Cell Line. Methods in molecular biology. 2016, 1434, 185-197. Přejít k původnímu zdroji...
  68. GIBSON, T. J., M. SEILER, and R. A. VEITIA. The transience of transient overexpression. Nature Methods. 2016, 10(8), 715-721. Přejít k původnímu zdroji...
  69. STEPANENKO, A. A. and H. H. HENG, Transient and stable vector transfection: Pitfalls, off-target effects, artifacts. Mutation Research - Reviews in Mutation Research. 2017, 773, 91-103. Přejít k původnímu zdroji...
  70. KIM, T. K. and J. H. EBERWINE. Mammalian cell transfection: The present and the future. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 2010, 397(8), 3173-3178. Přejít k původnímu zdroji...
  71. ANON. LentiFlash® particles - Vectalys [online] [accessed. 2019-05-03]. Available at: https://www.vectalys.com/lentiviral-based-technologies/what-is-lentiflash/
  72. JOGLEKAR, A. V. and S. SANDOVAL. Pseudotyped Lentiviral Vectors: One Vector, Many Guises. Human Gene Therapy Methods. 2017, 28(6), 291-301. Přejít k původnímu zdroji...
  73. SENA-ESTEVES, M., J. C. TEBBETS, S. STEFFENS, T. CROMBLEHOLME, and A. W. FLAKE. Optimized large-scale production of high titer lentivirus vector pseudotypes. Journal of Virological Methods. 2004, 122(2), 131-139. Přejít k původnímu zdroji...
  74. BARROW, K. M., F. M. PEREZ-CAMPO, and C. M. WARD. Use of the Cytomegalovirus Promoter for Transient and Stable Transgene Expression in Mouse Embryonic Stem Cells. Embryonic Stem Cell Protocols. [online], 329, 283-294. Přejít k původnímu zdroji...
  75. STEPANENKO, A. A. and H. H. HENG. Transient and stable vector transfection: Pitfalls, off-target effects, artifacts. Mutation Research - Reviews in Mutation Research. 2017, 773, 91-103. Přejít k původnímu zdroji...
  76. MENDENHALL, A., J. LESNIK, C. MUKHERJEE, T. ANTES, and R. SENGUPTA. Packaging HIV- or FIV-based Lentivector Expression Constructs & Transduction of VSV-G Pseudotyped Viral Particles. Journal of Visualized Experiments. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22508377].
  77. BERKHOUT, B. A. Fourth Generation Lentiviral Vector: Simplifying Genomic Gymnastics. Molecular Therapy. [online], 25(8), 1741-1743. Přejít k původnímu zdroji...
  78. BARDE, I., P. SALMON, and D. TRONO. Production and titration of lentiviral vectors. Current Protocols in Neuroscience. 2010, (SUPPL.53), 1-23. Přejít k původnímu zdroji...
  79. ADAN, A., Y. KIRAZ, and Y. BARAN. Cell Proliferation and Cytotoxicity Assays. Current Pharmaceutical Biotechnology. 2016; 17(14):1213-1221. Přejít k původnímu zdroji...
  80. SUMANTRAN, V. N. Cellular chemosensitivity assays: an overview. In: Cancer Cell Culture Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology USA: Humana Press; 2011. pp. 219-236. ISBN: 1064-3745. Přejít k původnímu zdroji...
  81. MERLIN, J. L., S. MARCHAL, C. RAMACCI, D. NOTTER, and C. VIGNERON. Antiproliferative activity of thermosensitive liposome-encapsulated doxorubicin combined with 43 degrees C hyperthermia in sensitive and multidrug-resistant MCF-7 cells. European Journal of Cancer. 1993; 29A(16):2264-2268. Přejít k původnímu zdroji...
  82. MOSMANN, T. Rapid colorimetric assay for cellular growth and survival: application to proliferation and cytotoxicity assays. Journal of Immunological Methods. 1983; 65(1-2):55-63. Přejít k původnímu zdroji...
  83. BERRIDGE, M. V., P. M. HERST, and A. S. TAN. Tetrazolium dyes as tools in cell biology: new insights into their cellular reduction. Biotechnology Annual Review. 2005; 11:127-152. Přejít k původnímu zdroji...
  84. CORY, A. H., T. C. OWEN, J. A. BARLTROP, and J. G. CORY. Use of an Aqueous Soluble Tetrazolium Formazan Assay for Cell-Growth Assays in Culture. Cancer Communications. 1991; 3(7):207-212. Přejít k původnímu zdroji...
  85. ROEHM, N. W., G. H. RODGERS, S. M. HATFIELD, and A. L. GLASEBROOK. An improved colorimetric assay for cell proliferation and viability utilizing the tetrazolium salt XTT. Journal of Immunological Methods. 1991; 142(2):257-265. Přejít k původnímu zdroji...
  86. LIAO, B., M. PATEL, Y. HU, S. CHARLES, D. J. HERRICK, and G. BREWER. Targeted knockdown of the RNA-binding protein CRD-BP promotes cell proliferation via an insulin-like growth factor II-dependent pathway in human K562 leukemia cells. Journal of Biological Chemistry. 2004; 279(47):48716-48724. Přejít k původnímu zdroji...
  87. SOURAL, M., J. HODOŇ, N. J. DICKINSON, V. ŠIDOVÁ, S. GURSKÁ, P. DŽUBÁK, M. HAJDÚCH, J. ŠAREK, and M. URBAN. Preparation of Conjugates of Cytotoxic Lupane Triterpenes with Biotin. Bioconjugate Chemistry. 2015; 26(12):2563-2570. Přejít k původnímu zdroji...
  88. TICHÝ, M., S. SMOLEN, E. TLOUŠŤOVÁ, R. POHL, T. OŽDIAN, M. HEJTMÁNKOVÁ, B. LIŠKOVÁ, S. GURSKÁ, P. DŽUBÁK, M. HAJDÚCH, and M. HOCEK. Synthesis and Cytostatic and Antiviral Profiling of Thieno-Fused 7-Deazapurine Ribonucleosides. Journal of Medicinal Chemistry. 2017; 60(6):2411-2424. Přejít k původnímu zdroji...
  89. FEND, F. and M. Raffeld. Laser capture microdissection in pathology. Journal of Clinical Pathology. 2000; 53(9): 666-672. Přejít k původnímu zdroji...
  90. PODGORNY, O. V. and V. N. LAZAREV. Laser microdissection: A promising tool for exploring microorganisms and their interactions with hosts. Journal of Microbiological Methods. 2017; 138: 82-92. Přejít k původnímu zdroji...
  91. LIU, H., T. MCDOWELL, N. HANSON, X. TANG, J. FUJIMOTO, and J. RODRIGUEZ-CANALES. Laser Capture Microdissection for the Investigative Pathologist. Veterinary Pathology. 2014; 51(1): 257-269. Přejít k původnímu zdroji...
  92. BEVILACQUA, C. and B. DUCOS. Laser microdissection: A powerful tool for genomics at cell level. Molecular Aspects of Medicine. 2018; 59: 5-27. Přejít k původnímu zdroji...
  93. JENSEN, E. Laser-Capture Microdissection. The Anatomical Record. 2013; 296(11): 1683-1687. Přejít k původnímu zdroji...
  94. MA, H. and R. O'KENNEDY. Recombinant antibody fragment production. Methods 2017; 116: 23-33. Přejít k původnímu zdroji...
  95. PRICHARD, J.W. Overview of automated immunohistochemistry. Arch Pathol Lab Med 2014; 138 (12): 1578-1582. Přejít k původnímu zdroji...
  96. BRADBURY, A. and A. PLUCKTHUN. Reproducibility: Standardize antibodies used in research. Nature 2015; 518 (7537): 27-29. Přejít k původnímu zdroji...
  97. ANDERSSON, S., M. SUNDBERG, N. PRISTOVSEK, A. IBRAHIM, P. JONSSON, B. KATONA, C. M. CLAUSSON, A. ZIEBA, M. RAMSTROM, O. SODERBERG, C. WILLIAMS, and A. ASPLUND. Insufficient antibody validation challenges oestrogen receptor beta research. Nat Commun 2017; 8: 15840. Přejít k původnímu zdroji...
  98. UHLEN, M., A. BANDROWSKI, S. CARR, A. EDWARDS, J. ELLENBERG, E. LUNDBERG, D. L. RIMM, H. RODRIGUEZ, T. HILTKE, M. SNYDER, and T. YAMAMOTO. A proposal for validation of antibodies. Nat Methods 2016; 13 (10): 823-827. Přejít k původnímu zdroji...
  99. KIM, S.W., J. ROH, and C.S. PARK. Immunohistochemistry for Pathologists: Protocols, Pitfalls, and Tips. J Pathol Transl Med. 2016; 50 (6): 411-418. Přejít k původnímu zdroji...
  100. TAYLOR, C.R. and L. RUDBECK. Immunohistochemical Staining Methods. 2013; sixth edition: 1-218. (IHC Guidebook, available from https://www.agilent.com/en/dako-pathology-education-guides)
  101. Dixon, a. r., C. bathany, M. tsuei, J. white, K. F. barald, and S. takayama. Recent developments in multiplexing techniques for immunohistochemistry. Expert Review of Molecular Diagnostics 2015; 15: 1171-1186. Přejít k původnímu zdroji...
  102. Van der loos, cm. Multiple immunoenzyme staining: Methods and visualizations for the observation with spectral imaging. Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 2008; 56: 313-28. Přejít k původnímu zdroji...
  103. Mason, d.y., K. micklem, and M. jones. Double immunofluorescence labelling of routinely processed paraffin sections. Journal of Pathology. 2000; 191: 452-61. Přejít k původnímu zdroji...
  104. Schubert, w., B. bonnekoh, A. J. pommer, L. philipsen, R. böckelmann, Y. malykh, H. gollnick, M. friedenberger, M. bode, and A. W. dress. Analyzing proteome topology and function by automated multidimensional fluorescence microscopy. Nature Biotechnology. 2006; 24: 1270-8. Přejít k původnímu zdroji...
  105. Rimm, d. l. Next-gen immunohistochemistry. Nature Methods. 2014; 11: 381-3. Erratum: rimm, d. l. Next-gen immunohistochemistry. Nature Methods. 2014; 11: 773-773. Přejít k původnímu zdroji...
  106. Chang, q., O. I. ornatsky, I. siddiqui, A. loboda, V. I. baranov, and D. W. hedley. Imaging Mass Cytometry. Cytometry Part A. 2017; 91(2):160-9. Přejít k původnímu zdroji...
  107. Giesen, c, h. a. o. wang, D. schapiro, N. zivanovic, A. jacobs, B. hattendorf, P. J. schüffler, D. grolimund, J. M. buhmann, S. brandt, Z. varga, P. J. wild, D. günther, and B. bodenmiller. Highly multiplexed imaging of tumor tissues with subcellular resolution by mass cytometry. Nature Methods. 2014; 11: 417-22. Přejít k původnímu zdroji...
  108. Stack e. c., C. wang, K. A. roman, and C. C. hoyt. Multiplexed immunohistochemistry, imaging, and quantitation: A review, with an assessment of Tyramide signal amplification, multispectral imaging and multiplex analysis. Methods. 2014; 70: 46-58. Přejít k původnímu zdroji...
  109. Voong, k. r., J. feliciano, D. becker, and B. levy. Beyond PD-L1 testing-emerging biomarkers for immunotherapy in non-small cell lung cancer. Annals of Translational Medicine. 2017; 5: 376-376. Přejít k původnímu zdroji...
  110. Chevrier, s., J. H. levine, v. r. t. zanotelli, K. silina, D. schulz, M. bacac, C. H. ries, L. ailles, M. A. S. jewett, H. moch, M. van den broek, C. beisel, M. B. stadler, C. gedye, B. reis, D. pe'er, and B. bodenmiller. An Immune Atlas of Clear Cell Renal Cell Carcinoma. Cell. 2017; 169: 736-749. Přejít k původnímu zdroji...
  111. Ijsselsteijn, m. e., T. P. brouwer, Z. abdulrahma, E. reidy, A. ramalheiro, A. M. heeren, A. vahrmeijer, E. S. jordanova, and N. F. miranda. Cancer immunophenotyping by 7 colour multispectral imaging without tyramide signal amplification. The Journal of Pathology. Clinical Research 2019; 5: 3-11. Přejít k původnímu zdroji...
  112. HOFFMAN, W., F. G. LAKKIS, and G. CHALASANI. B cells, antibodies, and more. Clin J Am Soc Nephrol. 2016; 11(1):137-54. Přejít k původnímu zdroji...
  113. KÖHLER, G. and C. MILSTEIN. Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity. 1975. J Immunol. 2005; 174(5):2453-5.
  114. SMITH, K. A., P. N. NELSON, P. WARREN, S. J. ASTLEY, P. G. MURRAY, and J. GREENMAN. Demystified...recombinant antibodies. J Clin Pathol. 2004; 57(9):912-7. Přejít k původnímu zdroji...
  115. LIPMAN, N. S., L. R. JACKSON, L. J. TRUDEL, and F. WEIS-GARCIA. Monoclonal versus polyclonal antibodies: distinguishing characteristics, applications, and information resources. ILAR J. 2005; 46(3):258-68. Přejít k původnímu zdroji...
  116. ODELL, I. D. and D. COOK. Immunofluorescence techniques. J Invest Dermatol. 2013; 133(1):e4. Přejít k původnímu zdroji...
  117. LICHTMAN, J. W. and J. A. CONCHELLO. Fluorescence microscopy. Nat Methods. 2005; 2(12):910-9. Přejít k původnímu zdroji...
  118. SANDERSON, M. J., I. SMITH, I. PARKER, and M. D. BOOTMAN. Fluorescence microscopy. Cold Spring Harb Protoc. 2014; 2014(10):pdb.top071795. Přejít k původnímu zdroji...
  119. WATERS, J. C. Accuracy and precision in quantitative fluorescence microscopy. J Cell Biol. 2009; 185(7):1135-48. Přejít k původnímu zdroji...
  120. HAMILTON, N. Quantification and its applications in fluorescent microscopy imaging. Traffic. 2009; 10(8):951-61. Přejít k původnímu zdroji...
  121. MISTRIK, M., L. OPLUSTILOVA, J. LUKAS, and J. BARTEK. Low-dose DNA damage and replication stress responses quantified by optimized automated single-cell image analysis. Cell Cycle. 2009; 8(16):2592-9. Přejít k původnímu zdroji...
  122. cell^R Software Manual (https://www.natur.cuni.cz/biologie/servisni-laboratore/laborator-konfokalni-a-fluorescencni-mikroskopie/manual-k-analyticke-casti-systemu-olympus-scan-r)
  123. LANGER-SAFER, P. R., M. LEVINE, and D. C. WARD. Immunological method for mapping genes on Drosophila polytene chromosomes. Proc Natl Acad Sci USA. 1982, 79 (14): 4381-5. Přejít k původnímu zdroji...
  124. BRIDGER, J. M. and E. V. VOLPI. Fluorescence in situ hybridization (FISH). Protocols and Applications. UK: Springer New York Dordrecht Heidelberg London 2010. Chapter 1 and 4, p.3-21, 51-71. ISSN 1064-3745. ISBN 978-1-60761-788-4. Přejít k původnímu zdroji...
  125. CAGIR, B., A. GELMANN, J. PARK, T. FAVA, A. TANKELEVITCH, E. V. BITTNER, J. E. WEAVER, J. P. PALAZZO, D. WEINBERG, R. D. FRY, and S. A. WALDMAN. A New Test for Recurrent Colon Cancer. Annals of Internal Medicine 1999, 131 (11): 805. Přejít k původnímu zdroji...
  126. ORIALO, A.V., H. E. JOHANSSON, Y. FEN and L. ZHANG, Stellaris® RNA Fluorescent In Situ Hybridization for the Simultaneous Detection of Immature and Mature Long Noncoding RNAs. Methods Mol Biol. 2016; 1402:119-134 Přejít k původnímu zdroji...
  127. AUSUBEL, F. M., R. BRENT, R. E. KINGSTON, D.D. MOORE, J. G. SEIDMAN, J. A. SMITH, and K. STRUHL (editors). In Situ Hybridization and Immunohistochemistry. In: Current Protocols in Molecular Biology. USA: John Wiley & Sons, Inc. 1994-2010. Vol. 2, chapter 14. ISSN 1934-3639.
  128. BERKOVCOVA, J., J. DRABEK, P. DZUBAK, M. HAJDUCH, M. KHOYLOU, V. KOUDELAKOVA, J. SROVNAL, M. STANKOVA, and R. TROJANEC. [In Czech] Detekce nádorových biomakerů v molekulárně biologické laboratoři. Česká rep.: Univerzita Palackého v Olomouci 2012. Kapitola 10, s.83-94. ISBN 978-80244-3002-7.
  129. MONTGOMERY, K.D., E. A. KEITGES, and J. MEYNE. Molecular Cytogenetics: Definition, Clinical Aspects, and Protocols. In: The AGT Cytogenetics Laboratory Manual. 3.vyd. Philadelphia: Lippincott-Raven Publishers 1997. Chapter 13, p. 557-595. ISBN 0397-51651-7.
  130. KOSMAN, D., C. M. MIZUTANI, D. LEMONS, W. G. COX, W. McGINNIS, and E. BIER. Multiplex Detection of RNA Expression in Drosophila Embryos. Science 2004, 6, 305: 846. Přejít k původnímu zdroji...
  131. NGUYEN, H. T., R. TROUILLON, S. MATSUOKA, M. FICHE, L. de LEVAL, B. BISIG, and M. A. GIJS. Microfluidics-assisted fluorescence in situ hybridization for advantageous human epidermal growth factor receptor 2 assessment in breast cancer. Lab Invest. 2017 Jan;97(1):93-103. Přejít k původnímu zdroji...
  132. RENSHAW, S. Immunohistochemistry. Bloxham: Scion; 2007.
  133. Fixation and Permeabilization in ICC IF: Novus Biologicals [Internet]. Novusbio.com. 2018 [cited 20 December 2018]. Available from: https://www.novusbio.com/support/fixation-and-permeabilization-in-icc-if
  134. CELIS, J. Cell biology. San Diego: Academic Press; 1998.
  135. Protocols | Cell Signaling Technology [Internet]. Cellsignal.com. 2018 [cited 20 December 2018]. Available from: https://www.cellsignal.com/contents/resources/protocols/resources-protocols
  136. Yale Immunofluorescence Protocol [Internet]. Sigma-Aldrich. 2018 [cited 20 December 2018]. Available from: https://www.sigmaaldrich.com/technical-documents/protocols/biology/yale-immunofluorescence-384-well-plates.html
  137. Applications.zeiss.com. 2018 [cited 20 December 2018]. Available from: https://applications.zeiss.com/C125792900358A3F/0/3C1DAE76330E42F7C12579EC0028F56B/$FILE/50-1-0025_the_clean_microscope_e.pdf
  138. Cellproduce.co.jp. 2018 [cited 20 December 2018]. Available from: http://cellproduce.co.jp/hp/wp-content/uploads/2014/02/3235c83500f44170b69238bb66c377f9.pdf
  139. LIGASOVÁ, A. and K. KOBERNA. DNA Replication: From Radioisotopes to Click Chemistry. Molecules. 2018; 23(11):3007. Přejít k původnímu zdroji...
  140. TAYLOR, J. H., P. S. WOODS, and W. L. HUGHES. The Organization and Duplication of Chromosomes as Revealed by Autoradiographic Studies Using Tritium-Labeled Thymidinee. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1957; 43(1):122-128. Přejít k původnímu zdroji...
  141. DIMITROVA, D. S. and R. BEREZNEY. The spatio-temporal organization of DNA replication sites is identical in primary, immortalized and transformed mammalian cells. Journal of Cell Science. 2002; 115(Pt 21):4037-4051. Přejít k původnímu zdroji...
  142. JACKSON, D. A. and A. POMBO. Replicon clusters are stable units of chromosome structure: evidence that nuclear organization contributes to the efficient activation and propagation of S phase in human cells. Journal of Cell Biology. 1998; 140(6):1285-1295. Přejít k původnímu zdroji...
  143. KENNEDY, B. K., D. A. BARBIE, M. CLASSON, N. DYSON, and E. HARLOW. Nuclear organization of DNA replication in primary mammalian cells. Genes & Development. 2000; 14(22):2855-2868. Přejít k původnímu zdroji...
  144. KOBERNA, K., A. LIGASOVÁ, J. MALÍNSKY, A. PLISS, A. J. SIEGEL, Z. CVAČKOVÁ, H. FIDLEROVÁ, M. MAŠATA, M. FIALOVÁ, I. RAŠKA, and R. BEREZNEY. Electron microscopy of DNA replication in 3-D: evidence for similar-sized replication foci throughout S-phase. Journal of Cellular Biochemistry. 2005; 94(1):126-138. Přejít k původnímu zdroji...
  145. AGENO, M., E. DORE and C. FRONTALI. The alkaline denaturation of DNA. Biophysical Journal. 1969; 9(11):1281-1311. Přejít k původnímu zdroji...
  146. DOLBEARE, F. and J. W. GRAY. Use of Restriction Endonucleases and Exonuclease-Iii to Expose Halogenated Pyrimidines for Immunochemical Staining. Cytometry. 1988; 9(6):631-635. Přejít k původnímu zdroji...
  147. FOX, M. H., D. J. ARNDT-JOVIN, T. M. JOVIN, P. H. BAUMANN, and M. ROBERT-NICOUD. Spatial and temporal distribution of DNA replication sites localized by immunofluorescence and confocal microscopy in mouse fibroblasts. Journal of Cell Science. 1991; 99 (Pt 2):247-253. Přejít k původnímu zdroji...
  148. LIGASOVÁ, A., P. KONEČNÝ, I. FRYDRYCH, and K. KOBERNA. Looking for ugly ducklings: The role of the stability of BrdU-antibody complex and the improved method of the detection of DNA replication. PLoS One. 2017; 12(3):e0174893. Přejít k původnímu zdroji...
  149. LIGASOVÁ, A., P. KONEČNÝ, I. FRYDRYCH, and K. KOBERNA. Cell cycle profiling by image and flow cytometry: The optimised protocol for the detection of replicational activity using 5-Bromo-2 '-deoxyuridine, low concentration of hydrochloric acid and exonuclease III. PLoS One. 2017; 12(4):e0175880. Přejít k původnímu zdroji...
  150. LIGASOVÁ, A., D. STRUNIN, R. LIBOSKA, I. ROSENBERG, and K. KOBERNA. Atomic Scissors: A New Method of Tracking the 5-Bromo-2 '-Deoxyuridine-Labeled DNA In Situ. PLoS One. 2012; 7(12):e52584. Přejít k původnímu zdroji...
  151. LI, X. and Z. DARZYNKIEWICZ. Labelling DNA strand breaks with BrdUTP. Detection of apoptosis and cell proliferation. Cell Proliferation. 1995; 28(11):571-579. Přejít k původnímu zdroji...
  152. SALIC, A. and T. J. MITCHISON. A chemical method for fast and sensitive detection of DNA synthesis in vivo. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2008; 105(7):2415-2420. Přejít k původnímu zdroji...
  153. ROSTOVTSEV, V. V., L. G. GREEN, V. V. FOKIN, and K. B. SHARPLESS. A stepwise huisgen cycloaddition process: copper(I)-catalyzed regioselective "ligation" of azides and terminal alkynes. Angewandte Chemie International Edition in English. 2002; 41(14):2596-2599. Přejít k původnímu zdroji...
  154. TORNOE, C. W., C. CHRISTENSEN, and M. MELDAL. Peptidotriazoles on solid phase: [1,2,3]-triazoles by regiospecific copper(i)-catalyzed 1,3-dipolar cycloadditions of terminal alkynes to azides. Journal of Organic Chemistry. 2002; 67(9):3057-3064. Přejít k původnímu zdroji...
  155. KOHLMEIER, F., A. MAYA-MENDOZA, and D. A. JACKSON. EdU induces DNA damage response and cell death in mESC in culture. Chromosome Research. 2013; 21(1):87-100. Přejít k původnímu zdroji...
  156. LIGASOVÁ, A., D. STRUNIN, D. FRIEDECKÝ, T. ADAM, and K. KOBERNA. A fatal combination: a thymidylate synthase inhibitor with DNA damaging activity. PLoS One. 2015; 10(2):e0117459. Přejít k původnímu zdroji...
  157. MENENI, S., I. OTT, C. D. SERGEANT, A. SNIADY, R. GUST, and R. DEMBINSKI. 5-Alkynyl-2'-deoxyuridines: chromatography-free synthesis and cytotoxicity evaluation against human breast cancer cells. Bioorganic & Medicinal Chemistry. 2007; 15(8):3082-3088. Přejít k původnímu zdroji...
  158. ZHAO, H., H. D. HALICKA, J. W. LI, E. BIELA, K. BERNIAK, J. DOBRUCKI, and Z. DARZYNKIEWICZ. DNA Damage Signaling, Impairment of Cell Cycle Progression, and Apoptosis Triggered by 5-Ethynyl-2 '-deoxyuridine Incorporated into DNA. Cytometry Part A. 2013; 83(11):979-988. Přejít k původnímu zdroji...
  159. ROSS, H. H., M. RAHMAN, L. H. LEVKOFF, S. MILLETTE, T. MARTIN-CARRERAS, E. M. DUNBAR, B. A. REYNOLDS, and E. D. LAYWELL. Ethynyldeoxyuridine (EdU) suppresses in vitro population expansion and in vivo tumor progression of human glioblastoma cells. Journal of Neuro-Oncology. 2011; 105(3):485-498. Přejít k původnímu zdroji...
  160. HENDERSON, L., D. S. BORTONE, C. LIM, and A. C. ZAMBON. Classic "broken cell" techniques and newer live cell methods for cell cycle assessment. American Journal of Physiology-Cell Physiology. 2013; 304(10):C927-938. Přejít k původnímu zdroji...
  161. HONG, V., N. F. STEINMETZ, M. MANCHESTER, and M. G. FINN. Labeling Live Cells by Copper-Catalyzed Alkyne-Azide Click Chemistry. Bioconjugate Chemistry. 2010; 21(10):1912-1916. Přejít k původnímu zdroji...
  162. LOSCHBERGER, A., T. NIEHORSTER, and M. SAUER. Click chemistry for the conservation of cellular structures and fluorescent proteins: ClickOx. Biotechnology Journal. 2014; 9(5):693-697. Přejít k původnímu zdroji...
  163. LIGASOVÁ, A., R. LIBOSKA, I. ROSENBERG, and K. KOBERNA. The Fingerprint of Anti-Bromodeoxyuridine Antibodies and Its Use for the Assessment of Their Affinity to 5-Bromo-2'-Deoxyuridine in Cellular DNA under Various Conditions. PLoS One. 2015; 10(7):e0132393. Přejít k původnímu zdroji...
  164. LIBOSKA, R., A. LIGASOVÁ, D. STRUNIN, I. ROSENBERG, and K. KOBERNA. Most anti-BrdU antibodies react with 2'-deoxy-5-ethynyluridine-the method for the effective suppression of this cross-reactivity. PLoS One. 2012; 7(12):e51679. Přejít k původnímu zdroji...
  165. LIGASOVÁ, A., and K. KOBERNA. Tracking Mitochondrial DNA In Situ. In: Mitochondrial DNA: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology. United States: Humana Press; 2016. pp. 81-92. ISBN: 1064-3745. Přejít k původnímu zdroji...
  166. MgCl2 (Magnesium chloride). Cold Spring Harbor Protocols. 2006; 2006(1):pdb.rec8123. Přejít k původnímu zdroji...
  167. TAANMAN, J. W. The mitochondrial genome: structure, transcription, translation and replication. Biochimica et Biophysica Acta. 1999; 1410(2):103-123. Přejít k původnímu zdroji...
  168. LIGASOVÁ, A., D. STRUNIN, and K. KOBERNA. A New Method of the Visualization of the Double-Stranded Mitochondrial and Nuclear DNA. PLoS One. 2013; 8(6):e66864. Přejít k původnímu zdroji...
  169. DELLINGER, M. and M. GEZE. Detection of mitochondrial DNA in living animal cells with fluorescence microscopy. Journal of Microscopy. 2001; 204(Pt 3):196-202. Přejít k původnímu zdroji...
  170. ASHLEY, N., D. HARRIS, and J. POULTON. Detection of mitochondrial DNA depletion in living human cells using PicoGreen staining. Experimental Cell Research. 2005; 303(2):432-446. Přejít k původnímu zdroji...
  171. KASASHIMA, K., Y. NAGAO, and H. ENDO. Dynamic regulation of mitochondrial genome maintenance in germ cells. Reproductive Medicine and Biology. 2014; 13:11-20. Přejít k původnímu zdroji...
  172. VAN ZANDVOORT, M. A. M. J., C. J. DE GRAUW, H. C. GERRITSEN, J. L. V. BROERS, M. G. A. O. EGBRINK, F. C. S. RAMAEKERS, and D. W. SLAAF. Discrimination of DNA and RNA in cells by a vital fluorescent probe: Lifetime Imaging of SYTO13 in healthy and apoptotic cells. Cytometry. 2002; 47(4):226-235. Přejít k původnímu zdroji...
  173. HAYASHI, J. I., M. TAKEMITSU, Y. GOTO, and I. NONAKA. Human Mitochondria and Mitochondrial Genome Function as a Single Dynamic Cellular-Unit. Journal of Cell Biology. 1994; 125(1):43-50. Přejít k původnímu zdroji...
  174. IBORRA, F. J., H. KIMURA, and P. R. COOK. The functional organization of mitochondrial genomes in human cells. BMC Biology. 2004; 2:9. Přejít k původnímu zdroji...
  175. MARGINEANTU, D. H., W. GREGORY COX, L. SUNDELL, S. W. SHERWOOD, J. M. BEECHEM, and R. A. CAPALDI. Cell cycle dependent morphology changes and associated mitochondrial DNA redistribution in mitochondria of human cell lines. Mitochondrion. 2002; 1(5):425-435. Přejít k původnímu zdroji...
  176. GARRIDO, N., L. GRIPARIC, E. JOKITALO, J. WARTIOVAARA, A. M. VAN DER BLIEK, and J. N. SPELBRINK. Composition and dynamics of human mitochondrial nucleoids. Molecular Biology of the Cell. 2003; 14(4):1583-1596. Přejít k původnímu zdroji...
  177. LIGASOVÁ, A. and K. KOBERNA. Tracking Mitochondrial DNA In Situ. In: Mitochondrial DNA: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology. United States: Humana Press; 2016. pp. 81-92. ISBN: 1064-3745. Přejít k původnímu zdroji...
  178. VAN DE CORPUT, M. P., J. M. VAN DEN OUWELAND, R. W. DIRKS, L. M. HART, G. J. BRUINING, J. A. MAASSEN, and A. K. RAAP. Detection of mitochondrial DNA deletions in human skin fibroblasts of patients with Pearson's syndrome by two-color fluorescence in situ hybridization. Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 1997; 45(1):55-61. Přejít k původnímu zdroji...
  179. DAVIS, A. F. and D. A. CLAYTON. In situ localization of mitochondrial DNA replication in intact mammalian cells. Journal of Cell Biology. 1996; 135(4):883-893. Přejít k původnímu zdroji...
  180. HAINES, K. M., E. L. FELDMAN, and S. I. LENTZ. Visualization of mitochondrial DNA replication in individual cells by EdU signal amplification. Journal of Visualized Experiments. 2010; 45:e2147. Přejít k původnímu zdroji...
  181. CHEN, Z. and H. XU. In Situ Labeling of Mitochondrial DNA Replication in Drosophila Adult Ovaries by EdU Staining. Journal of Visualized Experiments. 2016; 116:e54516. Přejít k původnímu zdroji...
  182. MAGNUSSON, J., M. ORTH, P. LESTIENNE, and J. W. TAANMAN. Replication of mitochondrial DNA occurs throughout the mitochondria of cultured human cells. Experimental Cell Research. 2003; 289(1):133-142. Přejít k původnímu zdroji...
  183. LIGASOVÁ, A., D. STRUNIN, R. LIBOSKA, I. ROSENBERG, and K. KOBERNA. Atomic Scissors: A New Method of Tracking the 5-Bromo-2 '-Deoxyuridine-Labeled DNA In Situ. PLoS One. 2012; 7(12):e52584. Přejít k původnímu zdroji...
  184. CALKINS, M. J. and P. H. REDDY. Assessment of newly synthesized mitochondrial DNA using BrdU labeling in primary neurons from Alzheimer's disease mice: Implications for impaired mitochondrial biogenesis and synaptic damage. Biochimica Et Biophysica Acta-Molecular Basis of Disease. 2011; 1812(9):1182-1189. Přejít k původnímu zdroji...
  185. CRISTOFOLI, W. A., L. I. WIEBE, E. DE CLERCQ, G. ANDREI, R. SNOECK, J. BALZARINI, and E. E. KNAUS. 5-alkynyl analogs of arabinouridine and 2'-deoxyuridine: cytostatic activity against herpes simplex virus and varicella-zoster thymidine kinase gene-transfected cells. Journal of Medicinal Chemistry. 2007; 50(12):2851-2857. Přejít k původnímu zdroji...
  186. DIERMEIER-DAUCHER, S., S. T. CLARKE, D. HILL, A. VOLLMANN-ZWERENZ, J. A. BRADFORD, and G. BROCKHOFF. Cell type specific applicability of 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) for dynamic proliferation assessment in flow cytometry. Cytometry A. 2009; 75(6):535-546. Přejít k původnímu zdroji...
  187. KOHLMEIER, F., A. MAYA-MENDOZA, and D. A. JACKSON. EdU induces DNA damage response and cell death in mESC in culture. Chromosome Research. 2013; 21(1):87-100. Přejít k původnímu zdroji...
  188. LIGASOVÁ, A., D. STRUNIN, D. FRIEDECKÝ, T. ADAM, and K. KOBERNA. A fatal combination: a thymidylate synthase inhibitor with DNA damaging activity. PLoS One. 2015; 10(2):e0117459. Přejít k původnímu zdroji...
  189. MENENI, S., I. OTT, C. D. SERGEANT, A. SNIADY, R. GUST, and R. DEMBINSKI. 5-Alkynyl-2'-deoxyuridines: chromatography-free synthesis and cytotoxicity evaluation against human breast cancer cells. Bioorganic & Medicinal Chemistry. 2007; 15(8):3082-3088. Přejít k původnímu zdroji...
  190. ZHAO, H., H. D. HALICKA, J. W. LI, E. BIELA, K. BERNIAK, J. DOBRUCKI, and Z. DARZYNKIEWICZ. DNA Damage Signaling, Impairment of Cell Cycle Progression, and Apoptosis Triggered by 5-Ethynyl-2 '-deoxyuridine Incorporated into DNA. Cytometry Part A. 2013; 83(11):979-988. Přejít k původnímu zdroji...
  191. LENTZ, S. I., J. L. EDWARDS, C. BACKUS, L. L. MCLEAN, K. M. HAINES, and E. L. FELDMAN. Mitochondrial DNA (mtDNA) Biogenesis: Visualization and Duel Incorporation of BrdU and EdU Into Newly Synthesized mtDNA In Vitro. Journal of Histochemistry & Cytochemistry. 2010; 58(2):207-218. Přejít k původnímu zdroji...
  192. LIGASOVÁ, A., P. KONEČNÝ, I. FRYDRYCH, and K. KOBERNA. Looking for ugly ducklings: The role of the stability of BrdU-antibody complex and the improved method of the detection of DNA replication. PLoS One. 2017; 12(3):e0174893. Přejít k původnímu zdroji...
  193. KODIHA, M., H. MAHBOUBI, and U. STOCHAJ. Exploring Subcellular Organization and function with Quantitative Fluorescent Microscopy' In: Microscopy : advances in scientific research and education. A. Méndez-Vilas, Ed., Formatex; 2014. ISBN: 978-84-942134-3-4.
  194. CHEN, X., M. VELLISTE, and R.F. MURPHY. Automated Interpretation of Subcellular Patterns in Fluorescence Miscroscope Images for Location Proteomics. Cytometry A. 2006, 69 (7): 631-640. Přejít k původnímu zdroji...
  195. KOHNORST, C.L., D.L SCHMITT, A. SUNDARAM, and S. AN. Subcellular functions of proteins under fluorescence single-cell microscopy. Biochim Biophys Acta. 2016, 1864(1): 77-84. Přejít k původnímu zdroji...
  196. STEPHENS, D.J. and V.J. ALLAN. Light Microscopy Techniques for Live Cell Imaging. Science. 2003, 300, 82-86. Přejít k původnímu zdroji...
  197. SCHINDELIN, J., I. ARGANDA-CARERAS, E. FRISE, V. KAYNIG, M. LONGAIR, T. PIETZSCH, S. PREIBISCH, C. RUEDEN, S. SAALFELD, B. SCHMID, J.Y. TINEVEZ, D.J. WHITE, V. HARTENSTEIN, K. ELICEIRI, P. TOMANCAK, and A. CARDONA. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nature methods. 2012, 9(7): 676-682. Přejít k původnímu zdroji...
  198. SCHEINDER, C.A., W.S. RASBAND, and K.W. ELICEIRI. NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis. 2012, 9(7): 671-675. Přejít k původnímu zdroji...
  199. PATTERSON, G., S. KNOBEL, W. SHARIF, S. KAIN, and D. PISTON. Use of the green fluorescent protein and its mutants in quantitative fluorescence microscopy. Biophysical Journal. 1997; 73(5):2782-2790. Přejít k původnímu zdroji...
  200. ALEM, J. and J. COOK. Reporter genes: Application to the study of mammalian gene transcription. Analytical Biochemistry. 1990; 188(2):245-254. Přejít k původnímu zdroji...
  201. GROSS, A., J. SCHOENDUBE, S. ZIMMERMANN, M. STEEB, R. ZENGERLE, and P. KOLTAY. Technologies for single-cell isolation. International Journal of Molecular Sciences. 2015; 16(8):16897-16919. Přejít k původnímu zdroji...
  202. PAUWELS, K., R. GIJSBERS, J. TOELEN, A. SCHAMBACH, K. WILLARD-GALLO, C. VERHEUST, Z. DEBYSER, and P. HERMAN. State-of-the-art lentiviral vectors for research use: Risk assessment and biosafety recommendations. Current Gene Therapy. 2009; 9(6):459-474. Přejít k původnímu zdroji...
  203. MacPhee, D. G. Epigenetics and epimutagens: some new perspectives on cancer, germ line effects and endocrine disrupters. Mutation Research. 1998; 400(1-2):369-379. Přejít k původnímu zdroji...
  204. Frommer, M., L. E. McDonald, D. S. Millar, C. M. Collis, f. Watt, g. w. Grigg, p. l. Molloy, and c. l. Paul. A genomic sequencing protocol that yields a positive display of 5-methylcytosine residues in individual DNA strands. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1992; 89(5):1827-1831. Přejít k původnímu zdroji...
  205. Clark, C., p. Palta, c. j. Joyce, c. Scott, e. Grundberg, p. Deloukas, a. Palotie, and a. j. Coffey. A comparison of the whole genome approach of MeDIP-seq to the targeted approach of the Infinium HumanMethylation450 BeadChip(reg) for methylome profiling. PLOS ONE. 2012; 7(11):e50233. Přejít k původnímu zdroji...
  206. Jørgensen, H. F., K. Adie, P. Chaubert, and A. P. Bird. Engineering a high-affinity methyl-CpG-binding protein. Nucleic Acids Research. 2006; 34(13):e96. Přejít k původnímu zdroji...
  207. Agrawal, K., v. Das, m. Otmar, m. Krečmerová, p. Džubák, and m. Hajdúch. Cell-based DNA demethylation detection system for screening of epigenetic drugs in 2D, 3D, and xenograft models. Cytometry A. 2017; 91(2):133-143. Přejít k původnímu zdroji...
  208. Okochi-Takada, E., S. Ichimura, A. Kaneda, T. Sugimura, and T. Ushijima. Establishment of a detection system for demethylating agents using an endogenous promoter CpG island. Mutation Research. 2004; 568(2):187-194. Přejít k původnímu zdroji...
  209. Kanda, T., k. f. Sullivan, and g.m. Wahl. Histone-GFP fusion protein enables sensitive analysis of chromosome dynamics in living mammalian cells. Current Biology. 1998; 8(7):377-385. Přejít k původnímu zdroji...
  210. MCHUGH, D. and J. GIL. Senescence and aging: causes, consequences, and therapeutic avenues. Journal of Cell Biology 2018; 217(1):65-77. Přejít k původnímu zdroji...
  211. KOSAR, M., J. BARTKOVA, S. HUBACKOVA, Z. HODNY, J. LUKAS, and J. BARTEK. Senescence-associated heterochromatin foci are dispensable for cellular senescence, occur in a cell type- and insult-dependent manner and follow expression of p16(ink4a). Cell Cycle 2011; 10(3):457-468. Přejít k původnímu zdroji...
  212. DE MAGALHÃES, J.P. and J.F. PASSOS. Stress, cell senescence and organismal ageing. Mechanisms of Ageing and Development 2018; 170:2-9. Přejít k původnímu zdroji...
  213. DI MICCO, R., M. FUMAGALLI, A. CICALESE, S. PICCININ, P. GASPARINI, C. LUISE, C. SCHURRA, M. GARRE', P.G. NUCIFORO, A. BENSIMON, R. MAESTRO, P.G. PELICCI, and F. D'ADDA DI FAGAGNA. Oncogene-induced senescence is a DNA damage response triggered by DNA hyper-replication. Nature 2006; 444(7119):638-642. Přejít k původnímu zdroji...
  214. CHILDS, B.G., M. GLUSCEVIC, D.J. BAKER, R.M. LABERGE, D. MARQUESS, J. DANANBERG, and J.M. VAN DEURSEN. Senescent cells: an emerging target for diseases of ageing. Nature Reviews Drug Discovery 2017; 16(10):718-735. Přejít k původnímu zdroji...
  215. ZHU, J., D. WOODS, M. MCMAHON, and J.M. BISHOP. Senescence of human fibroblasts induced by oncogenic Raf. Genes & Development 1998; 12(19):2997-3007. Přejít k původnímu zdroji...
  216. MIRZAYANS, R., B. ANDRAIS, G. HANSEN, and D. MURRAY. Role of p16INK4A in Replicative Senescence and DNA Damage-Induced Premature Senescence in p53-Deficient Human Cells. Biochemistry Research International 2012; 2012:951574. Přejít k původnímu zdroji...
  217. WATANABE, S., S. KAWAMOTO, N. OHTANI, and E. HARA. Impact of senescence-associated secretory phenotype and its potential as a therapeutic target for senescence-associated diseases. Cancer Science 2017; 108(4):563-569. Přejít k původnímu zdroji...
  218. NOREN HOOTEN, N. and M.K. EVANS. Techniques to Induce and Quantify Cellular Senescence. Journal of Visualised Experiments: JoVE 2017; 2017(123):55533. Přejít k původnímu zdroji...
  219. CAMPISI, J. Aging, Cellular Senescence, and Cancer. Annual Review of physiology 2013; 75:685-705. Přejít k původnímu zdroji...
  220. SOTO-GAMEZ, A. and M. DEMARIA. Therapeutic interventions for aging: the case of cellular senescence. Drug Discovery Today 2017; 22(5):786-795. Přejít k původnímu zdroji...
  221. GU, L. and M. KITAMURA. Sensitive Detection and Monitoring of Senescence-Associated Secretory Phenotype by SASP-RAP Assay. PLoS One 2012; 7(12):e52305. Přejít k původnímu zdroji...
  222. COPPÉ, J.P., P.Y. DESPREZ, A. KRTOLICA, and J. CAMPISI. The senescence-associated secretory phenotype: the dark side of tumor suppression. Annual Review of Pathology: Mechanisms of Disease 2010; 5:99-118. Přejít k původnímu zdroji...
  223. BIRAN, A., L. ZADA, P. ABOU KARAM, E. VADAI, L. ROITMAN, Y. OVADYA, Z. PORAT, and V. KRIZHANOVSKY. Quantitative identification of senescent cells in aging and disease. Aging Cell 2017; 16(4):661-671. Přejít k původnímu zdroji...
  224. MARTHANDAN, S., S. PRIEBE, P. HEMMERICH, K. KLEMENT, and S. DIEKMANN. Long-Term Quiescent Fibroblast Cells Transit into Senescence. PLoS One 2014; 9(12):e115597. Přejít k původnímu zdroji...
  225. KOVACOVICOVA, K., M. SKOLNAJA, M. HEINMAA, M. MISTRIK, P. PATA, I. PATA, J. BARTEK, and M. VINCIGUERRA. Senolytic Cocktail Dasatinib+Quercetin (D+Q) Does Not Enhance the Efficacy of Senescence-Inducing Chemotherapy in Liver Cancer. Frontiers in Oncology 2018; 8:459. Přejít k původnímu zdroji...
  226. CAHU, J., and B. SOLA. A Sensitive Method to Quantify Senescent Cancer Cells. Journal of Visualised Experiments: JoVE 2013; 2013(78):50494. Přejít k původnímu zdroji...
  227. WOLFF, S., J.S. WEISSMAN, and A. DILLIN. Differential Scales of Protein Quality Control. Cell. 2014; 157(1):52-64. Přejít k původnímu zdroji...
  228. HETZ, C. The unfolded protein response: controlling cell fate decisions under ER stress and beyond. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2012; 13(2):89-102. Přejít k původnímu zdroji...
  229. SONTAG, E.M., R.S. SAMANT, and J. FRYDMAN. Mechanisms and Functions of Spatial Protein Quality Control. Annual Review of Biochemistry. 2017; 86(1):97-122. Přejít k původnímu zdroji...
  230. DUBNIKOV, T., T. BEN-GEDALYA, and E. COHEN. Protein Quality Control in Health and Disease. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 2017; 9(3):a023523. Přejít k původnímu zdroji...
  231. HETZ, C., E. CHEVET, and S.A. OAKES. Proteostasis control by the unfolded protein response. Nature Cell Biology. 2015; 17(7):829-838. Přejít k původnímu zdroji...
  232. WALTER, P. and D. RON. The Unfolded Protein Response: From Stress Pathway to Homeostatic Regulation. Science. 2011; 334(6059):1081-1086. Přejít k původnímu zdroji...
  233. SAMALI, A., U. FITZGERALD, S. DEEGAN, and S. GUPTA. Methods for Monitoring Endoplasmic Reticulum Stress and the Unfolded Protein Response. International Journal of Cell Biology. 2010; 2010:1-11. Přejít k původnímu zdroji...
  234. RICHTER, K., M. HASLBECK, and J. BUCHNER. The Heat Shock Response: Life on the Verge of Death. Molecular Cell. 2010; 40(2):253-266. Přejít k původnímu zdroji...
  235. GOMEZ-PASTOR, R., E.T. BURCHFIEL, and D.J. THIELE. Regulation of heat shock transcription factors and their roles in physiology and disease. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2017; 19(1):4-19. Přejít k původnímu zdroji...
  236. KIM, Y.E., M.S. HIPP, A. BRACHER, M. HAYER-HARTL, and F. ULRICH HARTL. Molecular Chaperone Functions in Protein Folding and Proteostasis. Annual Review of Biochemistry. 2013; 82(1):323-355. Přejít k původnímu zdroji...
  237. OSLOWSKI, C.M. and F. URANO. Measuring ER Stress and the Unfolded Protein Response Using Mammalian Tissue Culture System. In: Methods in Enzymology. 2011, s. 71-92. ISBN 9780123851147. Přejít k původnímu zdroji...
  238. ANDERSON, D.J., R. LE MOIGNE, S. DJAKOVIC, B. KUMAR, J. RICE, S. WONG, J. WANG, B. YAO, E. VALLE, S. KISS VON SOLY, A. MADRIAGA, F. SORIANO, M.-K. MENON, Z.Y. WU, M. KAMPMANN, Y. CHEN, J.S. WEISSMAN, B.T. AFTAB, F.M. YAKES, L. SHAWVER, H.-J. ZHOU, D. WUSTROW, and M. ROLFE. Targeting the AAA ATPase p97 as an Approach to Treat Cancer through Disruption of Protein Homeostasis. Cancer Cell. 2015; 28(5):653-665. Přejít k původnímu zdroji...
  239. DOKLADNY, K., W. WHARTON, T.Y. MA, and P.L. MOSELEY. Lack of cross-tolerance following heat and cadmium exposure in functional MDCK monolayers. Journal of Applied Toxicology. 2008; 28(7):885-894. Přejít k původnímu zdroji...
  240. DAS, V., F. BRUZZESE, P. KONEČNÝ, F., IANNELLI, A. BUDILLON, and M. HAJDÚCH. Pathophysiologically relevant in vitro tumor models for drug screening. Drug Discovery Today. 2015, 20(12):848-55. Přejít k původnímu zdroji...
  241. LAO, Z., C. J. KELLY, X. Y. YANG, W. T. JENKINS, E. TOORENS, T. GANGULY, S. M. EVANS, and C. J. KOCH. Improved Methods to Generate Spheroid Cultures from Tumor Cells, Tumor Cells & Fibroblasts or Tumor-Fragments: Microenvironment, Microvesicles and MiRNA. PLoS One. 2015, 10(7):e0133895. Přejít k původnímu zdroji...
  242. WENZEL, C., B. RIEFKE, S. GRÜNDEMANN, A. KREBS, S. CHRISTIAN, F. PRINZ, M. OSTERLAND, S. GOLFIER, S. RÄSE, N. ANSARI, M. ESNER, M. BICKLE, F. PAMPALONI, C. MATTHEYER, E. H. STELZER, K. PARCZYK, S. PRECHTL, and P. STEIGEMANN. 3D high-content screening for the identification of compounds that target cells in dormant tumor spheroid regions. Experimental Cell Research. 2014, 323(1):131-43. Přejít k původnímu zdroji...
  243. LI, Q., C. CHEN, A. KAPADIA, Q. ZHOU, M. K. HARPER, J. SCHAACK, and D. V. LABARBERA. 3D Models of Epithelial-Mesenchymal Transition in Breast Cancer Metastasis: High-Throughput Screening Assay Development, Validation, and Pilot Screen. Journal of Bimolecular Screening. 2011, 16(2):141-54. Přejít k původnímu zdroji...
  244. DAS, V., T. FÜRST, S. GURSKÁ, P. DŽUBÁK, and M. HAJDÚCH. Reproducibility of Uniform Spheroid Formation in 384-Well Plates: The Effect of Medium Evaporation. Journal of Bimolecular Screening. 2016, 21(9):923-30. Přejít k původnímu zdroji...
  245. CELLI, J.P., I. RIZVI, A. R. BLANDEN, I. MASSODI, M. D. GLIDDEN, B. W. POGUE, and H. TAYYABA. An imaging-based platform for high-content, quantitative evaluation of therapeutic response in 3D tumour models. Scientific Reports. 2014, 4:3751. Přejít k původnímu zdroji...
  246. SOLOMON, M.A., J. LEMERA, and G. G. M. D'SOUZA. Development of an in vitro tumor spheroid culture model amenable to high-throughput testing of potential anticancer nanotherapeutics. Journal of Liposome Research. 2016, 26(3):246-60. Přejít k původnímu zdroji...
  247. COSTA, E.C., V. M. GASPAR, P. COUTINHO, and I. J. CORREIA. Optimization of liquid overlay technique to formulate heterogenic 3D co-cultures models. Biotechnology and Bioengineering. 2014, 111(8):1672-85. Přejít k původnímu zdroji...
  248. DAS, V., T. FÜRST, S. GURSKÁ, P. DŽUBÁK, and M. HAJDÚCH. Evaporation-reducing Culture Condition Increases the Reproducibility of Multicellular Spheroid Formation in Microtiter Plates. Journal of Visualized Experiments. 2017, 2017 (121):e55403. Přejít k původnímu zdroji...
  249. WALZL, A., N. KRAMER, G. MAZZA, M. ROSNER, D. FALKENHAGEN, M., HENGSTSCHLÄGER, S. P. DAGMAR, and D. HELMUT. A Simple and Cost Efficient Method to Avoid Unequal Evaporation in Cellular Screening Assays, Which Restores Cellular Metabolic Activity. International Journal of Applied Science and Technology. 2012, 2(6):17-25.
  250. BERTHIER, E., J. WARRICK, H. YU, and D. J. BEEBE. Managing evaporation for more robust microscale assays Part 1. Volume loss in high throughput assays. Lab Chip. 2008, 8(6):852-9. Přejít k původnímu zdroji...
  251. Salzer, R. and H. Siesler. Infrared and Raman Spectroscopic Imaging: Second, Completely Revised and Updated Edition. 2nd. Wiley; 2014. Print ISBN:9783527336524, Online ISBN:9783527678136. Přejít k původnímu zdroji...
  252. Socrates, G., Infrared and Raman characteristic group frequencies: tables and charts. 3rd ed. New York: Wiley; 2001. ISBN: 9780470093078.
  253. Reichenbächer, M. and J. Popp. Challenges in molecular structure determination. Heidelberg: Springer; 2012. ISBN: 9783642243905. Přejít k původnímu zdroji...
  254. Schie, I. W., R. Kiselev, C. Krafft, and J. Popp. Rapid acquisition of mean Raman spectra of eukaryotic cells for a robust single cell classification. The Analyst. 2016; 141(23):6387-6395. Přejít k původnímu zdroji...
  255. Webb, R. H. and C. K. Dorey. The Pixelated Image. In: Handbook of Biological Confocal Microscopy. Boston, MA: Springer US; 1995. pp. 41-51. ISBN:9780387259215 Přejít k původnímu zdroji...
  256. Wilhelm, S., Confocal Laser Scanning Microscopy. Jena, Germany: Carl Zeiss Microscopy; 2010.
  257. Timm, M., L. Saaby, L. Moesby, and E. W. Hansen. Considerations regarding use of solvents in in vitro cell based assays. Cytotechnology. 2013; 65(5):887-894. Přejít k původnímu zdroji...
  258. Thavarajah, R., V. K. Mudimbaimannar, U. K. Rao, K. Ranganathan, and J. Elizabeth. Chemical and physical basics of routine formaldehyde fixation. Journal of Oral and Maxillofacial Pathology. 2012; 16(3):400-405. Přejít k původnímu zdroji...
  259. DARZYNKIEWICZ, Z., J. ROBINSON, and H. CRISSMAN. Methods in Cell Biology, 41A: Flow cytometry. 2nd ed. Burlington: Elsevier; 1994. ISBN: 9780122030512.
  260. JENSEN, P.O., J. LARSEN, and J.K. LARSEN. Flow Cytometric Measurement of Rna Synthesis Based on Bromouridine Labelling and Combined with Measurement of Dna Content or Cell Surface Antigen. Acta Oncologica. 1993; 32(5):521-524. Přejít k původnímu zdroji...
  261. HOY, C.A., L.C. SEAMER, and R.T. SCHIMKE. Thermal denaturation of DNA for immunochemical staining of incorporated bromodeoxyuridine (BrdUrd): Critical factors that affect the amount of fluorescence and the shape of BrdUrd/DNA histogram. Cytometry. 1989; 10(6):718-725. Přejít k původnímu zdroji...
  262. GURLEY, L.R., J.A. D'ANNA, S.S. BARHAM, L.L. DEAVEN, and R.A. TOBEY. Histone Phosphorylation and Chromatin Structure during Mitosis in Chinese Hamster Cells. European Journal of Biochemistry. 1978; 84(1):1-15. Přejít k původnímu zdroji...
  263. GALLUZZI, L., I. VITALE, S. A. AARONSON, J. M. ABRAMS, D. ADAM, P. AGOSTINIS, E. S. ALNEMRI, L. ALTUCCI, I. AMELIO, D. W. ANDREWS, M. ANNICCHIARICO-PETRUZZELLI, A. V. ANTONOV, E. ARAMA, E. H. BAEHRECKE, N. A. BARLEV, N. G. BAZAN, F. BERNASSOLA, M. J. M. BERTRAND, K. BIANCHI, M. V. BLAGOSKLONNY, K. BLOMGREN, C. BORNER, P. BOYA, C. BRENNER, M. CAMPANELLA, E. CANDI, D. CARMONA-GUTIERREZ, F. CECCONI, F. K. CHAN, N. S. CHANDEL, E. H. CHENG, J. E. CHIPUK, J. A. CIDLOWSKI, A. CIECHANOVER, G. M. COHEN, M. CONRAD, J. R. CUBILLOS-RUIZ, P. E. CZABOTAR, V. D'ANGIOLELLA, T. M. DAWSON, V. L. DAWSON, V. DE LAURENZI, R. DE MARIA, K. M. DEBATIN, R. J. DEBERARDINIS, M. DESHMUKH, N. DI DANIELE, F. DI VIRGILIO, V. M. DIXIT, S. J. DIXON, C. S. DUCKETT, B. D. DYNLACHT, W. S. EL-DEIRY, J. W. ELROD, G. M. FIMIA, S. FULDA, A. J. GARCIA-SAEZ, A. D. GARG, C. GARRIDO, E. GAVATHIOTIS, P. GOLSTEIN, E. GOTTLIEB, D. R. GREEN, L. A. GREENE, H. GRONEMEYER, A. GROSS, G. HAJNOCZKY, J. M. HARDWICK, I. S. HARRIS, M. O. HENGARTNER, C. HETZ, H. ICHIJO, M. JAATTELA, B. JOSEPH, P. J. JOST, P. P. JUIN, W. J. KAISER, M. KARIN, T. KAUFMANN, O. KEPP, A. KIMCHI, R. N. KITSIS, D. J. KLIONSKY, R. A. KNIGHT, S. KUMAR, S. W. LEE, J. J. LEMASTERS, B. LEVINE, A. LINKERMANN, S. A. LIPTON, R. A. LOCKSHIN, C. LOPEZ-OTIN, S. W. LOWE, T. LUEDDE, E. LUGLI, M. MACFARLANE, F. MADEO, M. MALEWICZ, W. MALORNI, G. MANIC, J. C. MARINE, S. J. MARTIN, J. C. MARTINOU, J. P. MEDEMA, P. MEHLEN, P. MEIER, S. MELINO, E. A. MIAO, J. D. MOLKENTIN, U. M. MOLL, C. MUNOZ-PINEDO, S. NAGATA, G. NUNEZ, A. OBERST, M. OREN, M. OVERHOLTZER, M. PAGANO, T. PANARETAKIS, M. PASPARAKIS, J. M. PENNINGER, D. M. PEREIRA, S. PERVAIZ, M. E. PETER, M. PIACENTINI, P. PINTON, J. H. M. PREHN, H. PUTHALAKATH, G. A. RABINOVICH, M. REHM, R. RIZZUTO, C. M. P. RODRIGUES, D. C. RUBINSZTEIN, T. RUDEL, K. M. RYAN, E. SAYAN, L. SCORRANO, F. SHAO, Y. SHI, J. SILKE, H. U. SIMON, A. SISTIGU, B. R. STOCKWELL, A. STRASSER, G. SZABADKAI, S. W. G. TAIT, D. TANG, N. TAVERNARAKIS, A. THORBURN, Y. TSUJIMOTO, B. TURK, T. VANDEN BERGHE, P. VANDENABEELE, M. G. VANDER HEIDEN, A. VILLUNGER, H. W. VIRGIN, K. H. VOUSDEN, D. VUCIC, E. F. WAGNER, H. WALCZAK, D. WALLACH, Y. WANG, J. A. WELLS, W. WOOD, J. YUAN, Z. ZAKERI, B. ZHIVOTOVSKY, L. ZITVOGEL, G. MELINO, and G. KROEMER. Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018. Cell Death Differ. 2018; 25(3):486-541. Přejít k původnímu zdroji...
  264. KERR, J. F., A. H. WYLLIE, and A. R. CURRIE. Apoptosis: a basic biological phenomenon with wide-ranging implications in tissue kinetics. Br J Cancer. 1972; 26(4):239-257.257. Přejít k původnímu zdroji...
  265. KROEMER, G., and J. C. REED. Mitochondrial control of cell death. Nat Med. 2000; 6(5):513-519. Přejít k původnímu zdroji...
  266. FADOK, V. A., D. R. VOELKER, P. A. CAMPBELL, J. J. COHEN, D. L. BRATTON, and P. M. HENSON. Exposure of phosphatidylserine on the surface of apoptotic lymphocytes triggers specific recognition and removal by macrophages. J Immunol. 1992; 148(7):2207-2216. Přejít k původnímu zdroji...
  267. SKROTT, Z., M. MISTRIK, K. K. ANDERSEN, S. FRIIS, D. MAJERA, J. GURSKY, T. OZDIAN, J. BARTKOVA, Z. TURI, P. MOUDRY, M. KRAUS, M. MICHALOVA, J. VACLAVKOVA, P. DZUBAK, I. VROBEL, P. POUCKOVA, J. SEDLACEK, A. MIKLOVICOVA, A. KUTT, J. LI, J. MATTOVA, C. DRIESSEN, Q. P. DOU, J. OLSEN, M. HAJDUCH, B. CVEK, R. J. DESHAIES, and J. BARTEK. Alcohol-abuse drug disulfiram targets cancer via p97 segregase adaptor NPL4. Nature. 2017; 552(7684):194-199. Přejít k původnímu zdroji...
  268. MAJERA, D., Z. SKROTT, J. BOUCHAL, J. BARTKOVA, D. SIMKOVA, M. GACHECHILADZE, J. STEIGEROVA, D. KURFURSTOVA, J. GURSKY, G. KORINKOVA, K. CWIERTKA, Z. HODNY, M. MISTRIK, and J. BARTEK. Targeting genotoxic and proteotoxic stress-response pathways in human prostate cancer by clinically available PARP inhibitors, vorinostat and disulfiram. Prostate. 2019; 79(4):352-362. Přejít k původnímu zdroji...
  269. TRAHTEMBERG, U., M. ATALLAH, A. KRISPIN, I. VERBOVETSKI, and D. MEVORACH. Calcium, leukocyte cell death and the use of annexin V: fatal encounters. Apoptosis. 2007; 12(10):1769-1780. Přejít k původnímu zdroji...
  270. DIAMOND R.A. and S. DEMAGGIO. In Living Color, Berlin, Heidelberg: Springer; 2000. Přejít k původnímu zdroji...
  271. HEDLEY D.W. Flow Cytometric Assays of Anticancer Drug Resistance. Ann N Y Acad Sci. 1993 Mar;677(1 Clinical Flow):341-53. Přejít k původnímu zdroji...
  272. NOSKOVA V., P. DZUBAK, G. KUZMINA, A. LUDKOVA, D. STEHLIK, R. TROJANEC, A. JANOSTAKOVA, G. KORINKOVA, V. MIHAL, and M. HAJDUCH. In vitro chemoresistance profile and expression/function of MDR associated proteins in resistant cell lines derived from CCRF-CEM, K562, A549 and MDA MB 231 parental cells. Neoplasma. 2002;49(6).
  273. SMITH, A. G. and K.F. MACLEOD. Autophagy, Cancer Stem Cells & Drug Resistance. J Pathol. 2018;247(5):708-718 Přejít k původnímu zdroji...
  274. KAUSAR, S., F. WANG, and H. CUI. The Role Of Mitochondria In Reactive Oxygen Species Generation and its Implications for Neurodegenerative Diseases. Cells. 2018;7(12). pii: E274. Přejít k původnímu zdroji...
  275. SEO, B.J., S.H. YOON, and J.T. DO. Mitochondrial Dynamics In Stem Cells And Differentiation. Int J Mol Sci. 2018;19(12). Pii: E3893. Přejít k původnímu zdroji...
  276. VAN DER ENDE, M., S. GREFTE, R. PLAS, J. MEIJERINK, R.F. WITKAMP, J. KEIJER, and K. VAN NORREN. Mitochondrial Dynamics In Cancer-Induced Cachexia. Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2018;1870(2):137-150. Přejít k původnímu zdroji...
  277. ZHANG H., Y.W. FENG, and Y.M. YAO. Potential Therapy Strategy: Targeting Mitochondrial Dysfunction In Sepsis. Mil Med Res. 2018;5(1):41. Přejít k původnímu zdroji...
  278. LAROSA V. and C. REMACLE. Insights Into the Respiratory Chain and Oxidative Stress. Biosci Rep. 2018;38(5). Pii: Bsr20171492. Přejít k původnímu zdroji...
  279. AZIMZADEH, P., H. ASADZADEH AGHDAEI, P. TARBAN, M.M. AKHONDI, A. SHIRAZI, and H.R. KHORRAM KHORSHID. Comparison of three methods for mitochondria isolation from human liver cell line (HepG2). Gastroenterol Hepatol Bed Bench 2016;9(2):105-113).
  280. COTTET-ROUSSELLE, C., X. RONOT, X. LEVERVE, and J.F. MAYOL. Cytometric assessment of mitochondria using fluorescent probes. Cytometry A. 2011;79(6):405-25. Přejít k původnímu zdroji...
  281. LODKOWIC, D., W. TELFORD, J. SKOMMER, and Z. DARZYNKIEWICZ. Apoptosis And Beyond: Cytometry In Studies Of Programmed Cell Death. Methods Cell Biol. 2011;103:55-98. Přejít k původnímu zdroji...
  282. PERRY, S.W., J.P. NORMAN, J. BARBIERI, E.B. BROWN, and H.A. GELBARD. Mitochondrial Membrane Potential Probes and the Proton Gradient: A Practical Usage Guide. Biotechniques. 2011;50(2):98-115. Přejít k původnímu zdroji...
  283. BADWEY, J.A. and M.L. KARNOVSKY. Production Of Superoxide and Hydrogen Peroxide by an NADH Oxidase in Guinea Pig Polymorphonuclear Leukocytes. Modulation By Nucleotides and Divalent Cations. J. Biol Chem 1979;254:11530-11537 Přejít k původnímu zdroji...
  284. VOROBJEVA N., A. PRIKHODKO, I. GALKIN, O. PLETJUSHKINA, R. ZINOVKIN, G. SUD'INA, B. CHERNYAK, and B. PINEGIN. Mitochondrial Reactive Oxygen Species Are Involved in Chemoattractant-Induced Oxidative Burst and Degranulation of Human Neutrophils In vitro. Eur J Cell Biol. 2017;96(3):254-265. Přejít k původnímu zdroji...
  285. BOILARD, E. and P.R. FORTIN. Connective Tissue Diseases: Mitochondria Drive Netosis and Inflammation In LE. Nat Rev Rheumatol. 2016;12(4):195-6. Přejít k původnímu zdroji...
  286. PIMENTEL, A.A., P. FELIBERTT, F. SOJO, L. COLMAN, A. MAYORA, M.L. SILVA, H. ROJAS, R. DIPOLO, A.I. SUAREZ, R.S. COMPAGNONE, F. ARVELO, I. GALINDO-CASTRO, J.B. DE SANCTIS, P. CHIRINO, and G. BENAIM. The marine sponge toxin agelasine B increases the intracellular Ca(2+) concentration and induces apoptosis in human breast cancer cells (MCF-7). Cancer Chemother Pharmacol. 2012;69(1):71-83. Přejít k původnímu zdroji...
  287. LARA, L.L., H. RIVERA, C. PEREZ-P, I. BLANCA, N.E. BIANCO, and J.B. DE SANCTIS. Low density lipoprotein receptor expression and function in human polymorphonuclear leucocytes. Clin Exp Immunol. 1997;107(1):205-12. Přejít k původnímu zdroji...
  288. CLAYTON, D.A. and G.S. SHADEL. Purification of Mitochondria by Sucrose Step Density Gradient Centrifugation. Cold Spring Harb Protoc. 2014; doi:10.1101/pdb.prot080028 Přejít k původnímu zdroji...
  289. DANIELE, J.R., K. HEYDARI, E.A. ARRIAGA, and A. DILLIN. Identification and Characterization of Mitochondrial Subtypes in Caenorhabditis elegans via Analysis of Individual Mitochondria by Flow Cytometry. Anal Chem. 2016;88(12):6309-16. Přejít k původnímu zdroji...
  290. DANIELE, J.R., K. HEYDARI, and A. DILLIN. Mitochondrial Subtype Identification and Characterization. Curr Protoc Cytom. 2018;85(1):e41. Přejít k původnímu zdroji...
  291. CA Cancer J Clin. 2018 Nov;68(6):394-424. doi: 10.3322/caac.21492. Epub 2018 Sep 12. Přejít k původnímu zdroji...
  292. World wide cancer statistics. Cancer Research UK [online].: http://www.cancerresearchuk.org/health-professional/cancer-statistics/worldwide-cancer#heading-Zero
  293. GOTTESMAN, M. Mechanisms of Cancer Drug Resistance. Annual Review of Medicine. 2002, 53(1), 615-627 Přejít k původnímu zdroji...
  294. ZIGNOL, M., W. VAN GEMERT, D. FALZON, Ch. SISMANIDIS, P. GLAZIOU, K. FLOYD, and M. RAVIGLIONE. Surveillance of anti-tuberculosis drug resistance in the world: an updated analysis, 2007-2010. Bulletin of the World Health Organization. 2012, 90(2), 111-119 Přejít k původnímu zdroji...
  295. QUINTÁS-CARDAMA, A., H. KANTARJIAN, and J. CORTES. Mechanisms of Primary and Secondary Resistance to Imatinib in Chronic Myeloid Leukemia. Cancer Control. 2017, 16(2), 122-131 Přejít k původnímu zdroji...
  296. BECK, W. The cell biology of multiple drug resistance. Biochemical Pharmacology. 1987, 36(18), 2879-2887 Přejít k původnímu zdroji...
  297. FIDLER, IJ. Tumor heterogeneity and the biology of cancer invasion and metastasis. Cancer Res. 1978, 38(9), 2651-2660. Přejít k původnímu zdroji...
  298. DOYLE, L., W. YANG, L. ABRUZZO, T. KROGMANN, Y. GAO, A. RISHI, and D. ROSS. A multidrug resistance transporter from human MCF-7 breast cancer cells. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1998, 95(26), 15665-15670 Přejít k původnímu zdroji...
  299. HOPPER-BORGE, E., Z. S. CHEN, I. SHCHAVELEVA, M. BELINSKY, and G. KRUH. Analysis of the Drug Resistance Profile of Multidrug Resistance Protein 7 (ABCC10). Cancer Research. 2004, 64(14), 4927-4930 Přejít k původnímu zdroji...
  300. NAKANISHI, T. and D. ROSS. Breast cancer resistance protein (BCRP/ABCG2): its role in multidrug resistance and regulation of its gene expression. Chinese Journal of Cancer. 2012, 31(2), 73-99 Přejít k původnímu zdroji...
  301. SHAROM, F. Multidrug Resistance Protein: P-Glycoprotein. Drug Transporters. 2006,, 223-262. Přejít k původnímu zdroji...
  302. JURANKA, P. F., R. L. ZASTAWNY, and V. LING. P-glycoprotein: multidrug-resistance and a superfamily of membrane-associated transport proteins. The FASEB Journal. 1989, 3(14), 2583-2592. Přejít k původnímu zdroji...
  303. LIN, J. and M. YAMAZAKI. Role of P-Glycoprotein in Pharmacokinetics. Clinical Pharmacokinetics. 2003, 42(1), 59-98. Přejít k původnímu zdroji...
  304. STAUD, F. and P. PAVEK. Breast cancer resistance protein (BCRP/ABCG2). The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 2005, 37(4), 720-725 Přejít k původnímu zdroji...
  305. FLENS, M., G. ZAMAN, P. VALK, M. LZQUIERDO, and A. SCHROEIJERS. Tissue Distribution of the Multidrug Resistance Protein. Am. J. Pathol. 1996, 148(4), 1237-1247.
  306. KOOL, M., M. HAAS, G. SCHEFFER, R. SCHEPPER, and M. EIJK. Analysis of Expression of cMOAT (MRP2), MRP3, MRP4, and MRP5, Homologues of the Multidrug Resistance-associated Protein Gene (MRP1), in Human Cancer Cell Lines. Cancer Research. 1997, 57(16), 3537-3547.
  307. KOOL, Marcel, Marcel LINDEN, Marcel HAAS, Frank BAAS, and Piet BORST. Expression of Human MRP6, a Homologue of the Multidrug Resistance Protein Gene MRP1, in Tissues and Cancer Cells. Cancer Research. 1999, 59(1), 175-182.
  308. COLE, S., G BHARDWAJ, and J. GERLACH et al. Overexpression of a transporter gene in a multidrug-resistant human lung cancer cell line. Science. 1992, 258(5088), 1650-1654 Přejít k původnímu zdroji...
  309. BORST, P., R. EVERS, M. KOOL, and J. WIJNHOLDS. The multidrug resistance protein family. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. 1999, 1461(2), 347-357 Přejít k původnímu zdroji...
  310. BERGER, W., E. STEINER, M. GRUSCH, L. ELBLING, and M. MICKSCHE. Vaults and the major vault protein: Novel roles in signal pathway regulation and immunity. Cellular and Molecular Life Sciences. 2009, 66(1), 43-61 Přejít k původnímu zdroji...
  311. LEHMANN, T., A. R. WAGEEH TORKY, E. STEHFEST, S. HOFMANN, and H. FOTH. Expression of lung resistance-related protein, LRP, and multidrug resistance-related protein, MRP1, in normal human lung cells in long-term cultures. Archives of Toxicology. 2005, 79(10), 600-609. Přejít k původnímu zdroji...
  312. SCHEPER, R., H. BROXTERMAN, G. SCHEFFER, P. KAAIJK, W. DALTON, and T. VAN HEIJNINGEN. Overexpression of a Mr 110,000 Vesicular Protein in Non-P-Glycoprotein-mediated Multidrug Resistance. Cancer Research. 1993, 53(7), 1475-1479.
  313. RAIDL, M., W. BERGER, R. SCHULTE-HERMANN, D. KANDIOLER-ECKERSBERGER, S. KAPPEL, F. WRBA, M. MICKSCHE, and B. GRASL-KRAUPP. Expression of the lung resistance-related protein in human and rat hepatocarcinogenesis. American Journal of Physiology - Gastrointestinal and Liver Physiology. 2002, 283(5), 1117-1124 Přejít k původnímu zdroji...
  314. DOYLE, A. and D. ROSS. Multidrug resistance mediated by the breast cancer resistance protein BCRP (ABCG2). Oncogene. 2003, 22, 7340-7358. Přejít k původnímu zdroji...
  315. SARKADI, B., T. ORBÁN, and G. SZAKÁCS et al. Evaluation of ABCG2 Expression in Human Embryonic Stem Cells: Crossing the Same River Twice?. STEM CELLS. 2010, 28(1), 174-176 Přejít k původnímu zdroji...
  316. COORAY, H., C. BLACKMORE, L. MASKELL, and M. BARRAND. Localisation of breast cancer resistance protein in microvessel endothelium of human brain. Neuroreport. 2002, 13(16), 2059-2063. Přejít k původnímu zdroji...
  317. MALIEPAARD, M., G. SCHEFFER, I. FANEYTE, M. VAN GASTELEN, A. PIJNENBORG, and A. SCHINKEL. Subcellular Localization and Distribution of the Breast Cancer Resistance Protein Transporter in Normal Human Tissues. Cancer research. 2001, 61(8), 3458-3464.
  318. MUNRO, D. and J.R. TREBERG. A radical shift in perspective: mitochondria as regulators of reactive oxygen species. J Exp Biol. 2017;220(Pt7):1170-1180. Přejít k původnímu zdroji...
  319. HRYCAY, E.G. and S.M. BANDIERA. Involvement of Cytochrome P450 in Reactive Oxygen Species Formation and Cancer. Adv Pharmacol. 2015;74:35-84. Přejít k původnímu zdroji...
  320. LIOCHEV, S.I. Reactive oxygen species and the free radical theory of aging. Free Radic Biol Med. 2013; 60:1-4. Přejít k původnímu zdroji...
  321. GRIFFITHS, H.R., D. GAO and C. PARARASA. Redox regulation in metabolic programming and inflammation. Redox Biol. 2017;12:50-57. Přejít k původnímu zdroji...
  322. YANG, Y., A.V. BAZHIN, J. WERNER, and S. KARAKHANOVA. Reactive oxygen species in the immune system. Int Rev Immunol. 2013;32(3):249-70. Přejít k původnímu zdroji...
  323. CHEN, X., M. SONG, B. ZHANG, and Y. ZHANG. Reactive Oxygen Species Regulate T Cell Immune Response in the Tumor Microenvironment. Oxid Med Cell Longev. 2016;2016:1580967. Přejít k původnímu zdroji...
  324. Carocho, M., I.C.F.R. Ferreira, P. Morales, and M. Soković. Antioxidants and Prooxidants: Effects on Health and Aging. Oxid Med Cell Longev 2018;2018:1472708. Přejít k původnímu zdroji...
  325. Choi, H.S., J.W. Kim, Y.N. Cha, and C. Kim. A quantitative nitroblue tetrazolium assay for determining intracellular superoxide anion production in phagocytic cells. J Immunoassay Immunochem. 2006;27(1):31-44. Přejít k původnímu zdroji...
  326. DE SANCTIS, J.B. Detection of nitric oxide enzymse and its metabolites. Chapter 32. This book
  327. GOMES, A., E. FERNANDES and, J.L. LIMA Fluorescence probes used for detection of reactive oxygen species. J Biochem Biophys Methods. 2005;65(2-3):45-80. Přejít k původnímu zdroji...
  328. WINTERBOURN, C.C. The challenges of using fluorescent probes to detect and quantify specific reactive oxygen species in living cells. Biochim Biophys Acta. 2014;1840(2):730-8. Přejít k původnímu zdroji...
  329. ZIELONKA, J. and B. KALYANARAMAN. Hydroethidine- and MitoSOX-derived red fluorescence is not a reliable indicator of intracellular superoxide formation: another inconvenient truth. Free Radic Biol Med. 2010;48(8):983-1001. Přejít k původnímu zdroji...
  330. CARTER, W.O., P.K. NARAYANAN, and J.P. ROBINSON. Intracellular hydrogen peroxide and superoxide anion detection in endothelial cells. J Leuk Biol. 1994;55(2):253-258. Přejít k původnímu zdroji...
  331. DIKALOV, S.I. and D.G.HARRISON. Methods for Detection of Mitochondrial and Cellular Reactive Oxygen Species. Antioxid Redox Signal. 2014; 20(2): 372-382. Přejít k původnímu zdroji...
  332. ROGERS, G.W., S. NADANACIVA, R. SWISS, A.S. and DIVAKARUNI, Y. Will Assessment of fatty acid beta oxidation in cells and isolated mitochondria. Curr Protoc Toxicol. 2014;60:25.3.1-19. Přejít k původnímu zdroji...
  333. CZERSKA, M., K. MIKOŁAJEWSKA, M. ZIELIŃSKI, J. GROMADZIŃSKA, and W. WĄSOWICZ. Today's oxidative stress markers. Med Pr. 2015;66(3):393-405. Přejít k původnímu zdroji...
  334. TSIKAS, D. Assessment of lipid peroxidation by measuring malondialdehyde (MDA) and relatives in biological samples: Analytical and biological challenges. Anal Biochem. 2017;524:13-30. Přejít k původnímu zdroji...
  335. DE SANCTIS, J.B. Analysis of mitochondrial function by flow cytometry. Chapter 20. This book
  336. AZIZ, N., J. NOVOTNY, I. OBORNA, H. FINGEROVA, J. BREZINOVA, and M. SVOBODOVA Comparison of chemiluminescence and flow cytometry in the estimation of reactive oxygen and nitrogen species in human semen. Fertil Steril. 2010;94(7):2604-8. Přejít k původnímu zdroji...
  337. MARROCCO, I., F. ALTIERI, and I. PELUSO. Measurement and Clinical Significance of Biomarkers of Oxidative Stress in Humans. Oxid Med Cell Longev. 2017;2017:6501046. Přejít k původnímu zdroji...
  338. MONTES DE OCA, M., E. LOEB, S.H. TORRES, J.B. DE SANCTIS, N. HERNÁNDEZ, and C. TÁLAMO. Peripheral muscle alterations in non-COPD smokers. Chest. 2008;133(1):13-8. Přejít k původnímu zdroji...
  339. SONG, Y., J. LIAO, C. ZHA, B. WANG, and C.C. LIU. Simultaneous determination of 3-chlorotyrosine and 3-nitrotyrosine in human plasma by direct analysis in real time-tandem mass spectrometry. Acta Pharm Sin B. 2015;5(5):482-6. Přejít k původnímu zdroji...
  340. MANI, A.R., J.C. MORENO, T.J. VISSER, and K.P. MOORE. The metabolism and de-bromination of bromotyrosine in vivo. Free Radic Biol Med. 2016;90:243-51. Přejít k původnímu zdroji...
  341. ASHRAF, J.M., S. AHMAD, I. CHOI, N. AHMAD, M. FARHAN, G. TATYANA, and U. SHAHAB. Recent Advances in Detection of AGEs:Immunochemical, Bioanalytical and BiochemicalApproaches. IUBMB Life. 2015;67(12):897-913. Přejít k původnímu zdroji...
  342. TORRES, S.H., J.B. DE SANCTIS, M.L. BRICEÑO, N. HERNÁNDEZ, and H.J. FINOL. Inflammation and nitric oxide production in skeletal muscle of type 2 diabetic patients. J Endocrinol. 2004;181(3):419-27 Přejít k původnímu zdroji...
  343. SCHRÖTER, J. and J. SCHILLER. Chlorinated Phospholipids and Fatty Acids: (Patho)physiological Relevance, Potential Toxicity, and Analysis of Lipid Chlorohydrins. Oxid Med Cell Longev. 2016;2016:8386362. Přejít k původnímu zdroji...
  344. CADET, J. and F.R. WAGNER. DNA Base Damage by Reactive Oxygen Species, Oxidizing Agents, and UV Radiation. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2013; 5(2): a012559. Přejít k původnímu zdroji...
  345. CADET, J., K.J.A. DAVIES, M.H. MEDEIROS, P. DI MASCIO, and J.R. WAGNER. Formation and repair of oxidatively generated damage in cellular DNA. Free Radic Biol Med. 2017;107:13-34. Přejít k původnímu zdroji...
  346. STUEHR, D.J. and M.M. HAQUE. Nitric Oxide Synthase Enzymology In The 20 Years After The Nobel Prize. Br J Pharmacol. 2019;176(2):177-188. Přejít k původnímu zdroji...
  347. GRIESS, P. Bemerkungen Zu Der Abhandlung Der Hh. Weselsky Und Benedikt "Ueber Einige Azoverbindungen" Ber. Deutsch Chem. Ges. 1879, 12, 426. Přejít k původnímu zdroji...
  348. SHINN, M.B. Colorimetric Method For Determination Of Nitrate. Ind. Eng. Chem. Anal. Ed. 1941;13 (1), pp.33-35. Přejít k původnímu zdroji...
  349. CSONKA, C., T. PÁLI, P. BENCSIK, A. GÖRBE, P. FERDINANDY, and T. CSONT. Measurement of NO in Biological Samples. Br J Pharmacol. 2015;172(6):1620-32. Přejít k původnímu zdroji...
  350. WANG, Z., P.T. PIANOSI, K.A. KEOGH, F. ZAIEM, M. ALSAWAS, F. ALAHDAB, J. ALMASRI, K. MOHAMMED, L. LARREA-MANTILLA, W. FARAH, L. DARAZ, P. BARRIONUEVO, A.S. MORROW, L.J. PROKOP, and MH MURAD. The Diagnostic Accuracy Of Fractional Exhaled Nitric Oxide Testing In Asthma: A Systematic Review And Meta-Analyses. Mayo Clin Proc. 2018;93(2):191-198. Přejít k původnímu zdroji...
  351. XU, C., C. XIN, C. YU, M. WU, J. XU, W. QIN, Y. DING, X. WANG, L. LI, and W. HUANG. Fast Response Two-Photon Fluorogenic Probe Based On Schiff Base Derivatives For Monitoring Nitric Oxide Levels In Living Cells And Zebrafish. Chem Commun (Camb). 2018;54(96):13491-13494. Přejít k původnímu zdroji...
  352. PROLO, C., N. RIOS, L. PIACENZA, M.N. ÁLVAREZ, and R. RADI. Fluorescence And Chemiluminescence Approaches For Peroxynitrite Detection. Free Radic Biol Med. 2018;128:59-68. Přejít k původnímu zdroji...
  353. ZHAO, Q., H. ZHAO, Y. GUO, Z. ZHANG, Y. HU, and Y. TANG. Ultra-Rapid Detection Of Endogenous Nitric Oxide Based On Fluorescent Conjugated Polymers Probe. Anal Chem. 2018;90(21):12663-12669. Přejít k původnímu zdroji...
  354. GRIENDLING. K.K., R.M. TOUYZ, J.L. ZWEIER, S. DIKALOV, W. CHILIAN, Y.R. CHEN, D.G. HARRISON, A. BHATNAGAR, and THE AMERICAN HEART ASSOCIATION COUNCIL ON BASIC CARDIOVASCULAR SCIENCES. Measurement Of Reactive Oxygen Species, Reactive Nitrogen Species, And Redox-Dependent Signaling In The Cardiovascular System: A Scientific Statement From The American Heart Association. Circ Res. 2016;119(5):E39-75. Přejít k původnímu zdroji...
  355. BARTESAGHI, S., and R. RADI. Fundamentals On The Biochemistry Of Peroxynitrite And Protein Tyrosine Nitration. Redox Biol. 2018;14:618-625. Přejít k původnímu zdroji...
  356. TEIXEIRA, D., R. FERNANDES, C. PRUDÊNCIO, and M. VIEIRA. 3-Nitrotyrosine Quantification Methods: Current Concepts And Future Challenges. Biochimie. 2016;125:1-11. Přejít k původnímu zdroji...
  357. Wolhuter, K. and P. Eaton. How Widespread Is Stable Protein S-Nitrosylation As An End-Effector Of Protein Regulation? Free Radic Biol Med. 2017;109:156-166. Přejít k původnímu zdroji...
  358. IYER, A.K., Y. ROJANASAKUL, and N. AZAD. Nitrosothiol Signaling And Protein Nitrosation In Cell Death. Nitric Oxide. 2014;42:9-18. Přejít k původnímu zdroji...
  359. DIERS, A.R., A. KEZSLER, and N. HOGG. Detection of S-Nitrosothiols. Biochim Biophys Acta. 2014; 1840(2): 892-900. Přejít k původnímu zdroji...
  360. SAINI, R. and S. SINGH. Inducible Nitric Oxide Synthase: An Asset To Neutrophils. J Leukoc Biol. 2019;105(1):49-61. Přejít k původnímu zdroji...
  361. XUE, Q., Y. YAN, R. ZHANG, and H. XIONG. Regulation Of iNOS On Immune Cells And Its Role In Diseases. Int J Mol Sci. 2018;19(12). Pii: E3805. Přejít k původnímu zdroji...
  362. ZHANG Y.H. Nitric Oxide Signalling And Neuronal Nitric Oxide Synthase In The Heart Under Stress. F1000res. 2017;6:742. Přejít k původnímu zdroji...
  363. SHARMA, N.M. and K.P. PATEL. Post-Translational Regulation Of Neuronal Nitric Oxide Synthase: Implications For Sympathoexcitatory States. Expert Opin Ther Targets. 2017;21(1):11-22. Přejít k původnímu zdroji...
  364. SUBIELA, J.V., S.H. TORRES, J.B. DE SANCTIS, and N. HERNÁNDEZ. Cardiorespiratory Responses, Nitric Oxide Production And Inflammatory Factors In Patients With Myocardial Infarction After Rehabilitation. Nitric Oxide. 2018;76:87-96. Přejít k původnímu zdroji...
  365. BONCOEUR, É., G.F. BOUVET, F. MIGNEAULT, V. TARDIF, P. FERRARO, D. RADZIOCH, J.B. DE SANCTIS, D. EIDELMAN, K. GOVINDARAJU, A. DAGENAIS, and Y. BERTHIAUME. Induction Of Nitric Oxide Synthase Expression By Lipopolysaccharide Is Mediated By Calcium-Dependent Pkcα-Β1 In Alveolar Epithelial Cells. Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. 2013;305(2):L175-84. Přejít k původnímu zdroji...
  366. MONTES DE OCA, M., E. LOEB, S.H. TORRES, J.B. DE SANCTIS, and N. HERNÁNDEZ, C. TÁLAMO. Peripheral Muscle Alterations In Non-Copd Smokers. Chest. 2008;133(1):13-8. Přejít k původnímu zdroji...
  367. MONTES DE OCA, M., S.H. TORRES, J.B. DE SANCTIS, A. MATA, N. HERNÁNDEZ, and C. TÁLAMO. Skeletal Muscle Inflammation And Nitric Oxide In Patients With Copd. Eur Respir J. 2005;26(3):390-7. Přejít k původnímu zdroji...
  368. TORRES, S.H., J.B. DE SANCTIS, M.L. BRICEÑO, N. HERNÁNDEZ, and H.J. FINOL. Inflammation And Nitric Oxide Production In Skeletal Muscle Of Type 2 Diabetic Patients. J Endocrinol. 2004;181(3):419-27. Přejít k původnímu zdroji...
  369. ZABALETA, M., R. MARINO, J. BORGES, B. CAMARGO, P. ORDAZ, J.B. DE SANCTIS, and N.E. BIANCO. Activity Profile In Multiple Sclerosis: An Integrative Approach. A Preliminary Report. Mult Scler. 2002;8(4):343-9. Přejít k původnímu zdroji...
  370. GARMENDIA, J.V., Y. GUTIÉRREZ, I. BLANCA, N.E. BIANCO, and J.B. DE SANCTIS. Nitric Oxide In Different Types Of Hypertension During Pregnancy. Clin Sci (Lond). 1997;93(5):413-21. Přejít k původnímu zdroji...
  371. THOMAS, A.C. and J.T. MATTILA. "Of Mice And Men": Arginine Metabolism In Macrophages. Front Immunol. 2014;5:479. Přejít k původnímu zdroji...
  372. Sielaff, M., J. KUHAREV, T. BOHN, J. Hahlbrock, T. Bopp, and S. TENZER. Evaluation of FASP, SP3, and iST Protocols for Proteomic Sample Preparation in the Low Microgram Range. J Proteome Res. 2017; 16(11):4060-72. Přejít k původnímu zdroji...
  373. Rogers J. C. and R. D. Bomgarden. Sample Preparation for Mass Spectrometry-Based Proteomics; from Proteomes to Peptides. In: Advances in experimental medicine and biology. Spinger US; 2016. pp. 43-62. ISBN:978-3-319-41446-1 Přejít k původnímu zdroji...
  374. Kulak, N.A., G. Pichler, I. Paron, N. Nagaraj, and M. Mann. Minimal, encapsulated proteomic-sample processing applied to copy-number estimation in eukaryotic cells. Nat Methods. 2014; 11(3):319-24. Přejít k původnímu zdroji...
  375. Wiśniewski J. R., A. Zougman, N. Nagaraj, and M. Mann. Universal sample preparation method for proteome analysis. Nat Methods. 2009; 6(5):359-62. Přejít k původnímu zdroji...
  376. Lai, Z.W., J. Weisser,L. Nilse, F. Costa, E. Keller, and M. Tholen. Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Tissues (FFPE) as a Robust Source for the Profiling of Native and Protease-Generated Protein Amino Termini. Mol Cell Proteomics. 2016; 15(6):2203-13. Přejít k původnímu zdroji...
  377. Wiśniewski J. R., A. Zougman, N. Nagaraj, and M. Mann. Universal sample preparation method for proteome analysis. Nat Methods. 2009; 6(5):359-62. Přejít k původnímu zdroji...
  378. Wang, D., B. Eraslan, T. Wieland, B. Hallström, T. Hopf, and D. P. Zolg. A deep proteome and transcriptome abundance atlas of 29 healthy human tissues. Mol Syst Biol. 2019; 15(2):e8503. Přejít k původnímu zdroji...
  379. Uhlen, M., L. Fagerberg, B. M. Hallstrom, C. Lindskog, P. Oksvold, and A. Mardinoglu. Tissue-based map of the human proteome. Science. 2015; 347(6220):1260419-1260419. Přejít k původnímu zdroji...
  380. Engvall E. and P. Perlmann. Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Quantitative assay of immunoglobulin G. Immunochemistry. 1971;8(9):871-874. Přejít k původnímu zdroji...
  381. Griffiths J. A brief history of mass spectrometry. Anal Chem. 2008;80(15):5678-83. Přejít k původnímu zdroji...
  382. Paul W and H. Steinwedel. Ein neues Massenspektrometer ohne Magnetfeld. Z Für Naturforschung A. 1953;8(7):448-450. Přejít k původnímu zdroji...
  383. Yost R. A. and C. G. Enke. Selected ion fragmentation with a tandem quadrupole mass spectrometer. J Am Chem Soc. 1978;100(7):2274-2275. Přejít k původnímu zdroji...
  384. Chernushevich I. V., A. V. Loboda, and B. A. Thomson. An introduction to quadrupole-time-of-flight mass spectrometry. J Mass Spectrom JMS. 2001;36(8):849-865. Přejít k původnímu zdroji...
  385. MacLean B., D. M. Tomazela, N. Shulman, M. Chambers, G. L. Finney, B. Frewen, R. Kern, D. L. Tabb, D. C. Liebler, and M. J. MacCoss. Skyline: an open source document editor for creating and analyzing targeted proteomics experiments. Bioinformatics. 2010;26(7):966-968. Přejít k původnímu zdroji...
  386. BLAST [Internet]. [cited 2018 Dec 14]. Available from: https://www.uniprot.org/blast/
  387. Kusebauch U., D. S. Campbell, E. W. Deutsch, C. S. Chu, D. A. Spicer, M. Y. Brusniak, J. Slagel, Z. Sun, J. Stevens, B. Grimes, D. Shteynberg, M. R. Hoopmann, P. Blattmann, A. V. Ratushny, O. Rinner, P. Picotti, C. Carapito, C. Y. Huang, M. Kaposouz, H. Lam, T. Tran, E. Demir, J. D. Aitchison, C. Sander, L. Hood, R. Aebersold, and R. L. Moritz. Human SRMAtlas: A Resource of Targeted Assays to Quantify the Complete Human Proteome. Cell. 2016;166(3):766-778. Přejít k původnímu zdroji...
  388. Release Notes: /home/software/Skyline [Internet]. [cited 2018 Dec 11]. Available from: https://skyline.ms/project/home/software/Skyline/begin.view?pageId=Release%20Notes
  389. Differences Between Using Acetonitrile and Methanol for Reverse Phase Chromatography : SHIMADZU (Shimadzu Corporation) [Internet]. [cited 2018 Dec 17]. Available from: https://www.shimadzu.com/an/hplc/support/lib/lctalk/35/35lab.html
  390. McMaster M. C. HPLC: A Practical User's Guide. John Wiley & Sons; 2007. ISBN: 0471754013 Přejít k původnímu zdroji...
  391. The LC handbook: Guide to LC Columns and method development [Internet]. 2nd ed. Agilent Technologies, Inc.; 2016. 200 p. Available from: https://www.agilent.com/cs/library/primers/Public/LC-Handbook-Complete-2.pdf
  392. Guideline on bioanalytical method validation [Internet]. European Medicines Agency; 2012. Available from: https://www.ema.europa.eu/documents/scientific-guideline/guideline-bioanalytical-method-validation_en.pdf
  393. Reviewer Guidance: Validation of Chromatographic Methods [Internet]. Center for Drug Evaluation and Research; Food and Drug Administration; 1994. Available from: https://www.fda.gov/downloads/drugs/guidances/ucm134409.pdf
  394. KAGADIS, G.C., N.L. FORD, D.N. KARNABATIDIS, and G. K. LOUDOS. Handbook of small animal imaging. 1st ed. Boca Raton: CRC Press; 2016. ISBN: 9781466555686. Přejít k původnímu zdroji...
  395. KIESSLING, F., B.J. PICHLER, and P. HAUFF. Small animal imaging. 2nd ed. Cham: Springer International Publishing AG; 2017. ISBN: 9783319422008. Přejít k původnímu zdroji...
  396. OCAK, M., A. HELBOK, E. VON GUGGENBERG, Y. OZSOY, L. KABASAKAL, L. KREMSER, and C. DECRISTOFORO. Influence of biological assay conditions on stability assessment of radiometal-labelled peptides exemplified using a 177Lu-DOTA-minigastrin derivative. Nuclear Medicine and Biology. 2011; 38:171-179. Přejít k původnímu zdroji...
  397. PETRIK, M., C. ZHAI, Z. NOVY, L. URBANEK, H. HAAS, and C. DECRISTOFORO. In vitro and in vivo comparison of selected Ga-68 and Zr-89 labelled siderophores. Molecular Imaging and Biology. 2015; 18:344-352. Přejít k původnímu zdroji...
  398. PETRIK, M., E. UMLAUFOVA, V. RACLAVSKY, A. PALYZOVA, V. HAVLICEK, H. HAAS, Z. NOVY, D. DOLEZAL, M. HAJDUCH, and C. DECRISTOFORO. Imaging of Pseudomonas aeruginosa infection with Ga-68 labelled pyoverdine for positron emission tomography. Scientific Reports. 2018; 8:15698. Přejít k původnímu zdroji...
  399. SUMMER, D., L. GROSSRUBATSCHER, M. PETRIK, T. MICHALCIKOVA, Z. NOVY, C. RANGGER, M. KLINGLER, E. VON GUGGENBERG, R. HAUBNER, P. KAEOPOOKUM, H. HAAS, and C. DECRISTOFORO. Developing targeted hybrid imaging probes by chelator scaffolding. Bioconjugate Chemistry. 2017; 28:1722-1733. Přejít k původnímu zdroji...
  400. Kowalsky, R.J. and S.W. Falen. Radiopharmaceuticals in Nuclear Pharmacy and Nuclear Medicine. 3rd edition. Washington (USA): American Pharmacists Association, 2011:741. ISBN: 1582121184.
  401. Reilly, M. Monoclonal Antibody and Peptide-Targeted Radiotherapy of Cancer. 1st edition. New York (USA): John Wiley and sons, 2010, 624. ISBN: 0470243724. Přejít k původnímu zdroji...
  402. Price, E.W. and C. Orvig. Matching chelators to radiometals for radiopharmaceuticals. Chemical Society Reviews. 2014, 43(1), 260-90. Přejít k původnímu zdroji...
  403. Saha, G.B. Fundamentals of Nuclear Pharmacy, 6th edition. New York (USA): Springer Science, 2010: 410. Přejít k původnímu zdroji...
  404. European Pharmacopoeia (Ph. Eur.) 9th Edition, Strasbourg: Council of Europe, 2017. ISBN: 978-3-7692-6633-7.
  405. Kagadis, G.C., N.L. Ford, D.N. Karnabatidis, and G.K. Loudos. Handbook of Small Animal Imaging. Boca Raton (USA): Taylor and Francis, 2016:601. Přejít k původnímu zdroji...
  406. Kiessling, F., B.J. Pichler, and P. Hauf. Small Animal Imaging. 2nd edition. Cham (Switzerland): Springer, 2017:875. ISBN: 978-3-319-42200-8. Přejít k původnímu zdroji...
  407. Petrik, M., E. Umlaufova, V. Raclavsky, A. Palyzova, V. Havlicek, H. Haas, Z. Novy, D. Dolezal, M. Hajduch, and C. Decristoforo. Imaging of Pseudomonas aeruginosa infection with Ga-68 labelled pyoverdine for positron emission tomography. Scientific Reports. 2018, 8, 15698. Přejít k původnímu zdroji...
  408. Dhein, S., F.W. Mohr, and M. Delmar. Practical methods in cardiovascular research. Berlin (Germany): Springer-Verlag, 2005, 723-759. Přejít k původnímu zdroji...
  409. Müller, S.A., K. Holzapfel, C. Seidl, U. Treiber, B.J. Krause, and R. Senekowitsch-Schmidtke. Characterization of choline uptake in prostate cancer cells following bicalutamide and docetaxel treatment. European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging 2009; 36, 1434-1442. Přejít k původnímu zdroji...
  410. Björkelund, H., L. Gedda, M. Malmqvist, and K. Andersson. Resolving the EGF-EGFR interaction characteristics through a multiple-temperature, multiple-inhibitor, real-time interaction analysis approach. Molecular and Clinical Oncology 2013; 1(2), 343-352. Přejít k původnímu zdroji...
  411. Smith, P.K., R.I. Krohn, G.T. Hermanson, A.K. Mallia, F.H. Gartner, M.D. Provenzano, E.K. Fujimoto, N.M. Goeke, B.j. Olson, and D.C. Klenk. Measurement of protein using bicinchoninic acid. Analytical Biochemistry. 1985, 150(1), 76-85. Přejít k původnímu zdroji...
  412. RALEVIC, V., and G. BURNSTOCK. Receptors for purines and pyrimidines. Pharmacol. Rev. 1998;50(3):413-92.
  413. FREDHOLM, B. B., A. P. IJZERMAN, K. A. JACOBSON, K. N. KLOTZ, and J. LINDEN. International Union of Pharmacology. XXV. Nomenclature and classification of adenosine receptors. Pharmacol. Rev. 2001;53(4):527-52.
  414. MÜLLER, C. E., and K. A. JACOBSON. Recent developments in adenosine receptor ligands and their potential as novel drugs. Biochim. Biophys. Acta - Biomembr. 2011;1808(5):1290-308. Přejít k původnímu zdroji...
  415. MCINTOSH, V. J., and R. D. LASLEY. Adenosine Receptor-Mediated Cardioprotection. J. Cardiovasc. Pharmacol. Ther. 2012;17(1):21-33. Přejít k původnímu zdroji...
  416. SAWYNOK, J., M. R. ZARRINDAST, A. R. REID, and G. J. DOAK. Adenosine A3 receptor activation produces nociceptive behaviour and edema by release of histamine and 5-hydroxytryptamine. Eur. J. Pharmacol. 1997;333(1):1-7. Přejít k původnímu zdroji...
  417. DOMENICI, M. R., M. L. SCATTONI, A. MARTIRE, G. LASTORIA, R. L. POTENZA, A. BORIONI, A. VENEROSI, G. CALAMANDREI, and P. POPOLI. Behavioral and electrophysiological effects of the adenosine A2A receptor antagonist SCH 58261 in R6/2 Huntington's disease mice. Neurobiol. Dis. 2007;28(2):197-205. Přejít k původnímu zdroji...
  418. MORI, A., and T. SHINDOU. Modulation of GABAergic transmission in the striatopallidal system by adenosine A2A receptors: a potential mechanism for the antiparkinsonian effects of A2A antagonists. Neurology. 2003;61(11 Suppl 6):S44-8. Přejít k původnímu zdroji...
  419. OCHAION, A., S. BAR-YEHUDA, S. COHEN, F. BARER, R. PATOKA, H. AMITAL, T. REITBLAT, A. REITBLAT, J. OPHIR, I. KONFINO, Y. CHOWERS, S. BEN-HORIN, and P. FISHMAN. The anti-inflammatory target A3 adenosine receptor is over-expressed in rheumatoid arthritis, psoriasis and Crohn's disease. Cell. Immunol. 2009;258(2):115-22. Přejít k původnímu zdroji...
  420. FISHMAN, P., S. BAR-YEHUDA, G. OHANA, F. BARER, A. OCHAION, A. ERLANGER, and L. MADI. An agonist to the A3 adenosine receptor inhibits colon carcinoma growth in mice via modulation of GSK-3 beta and NF-kappa B. Oncogene. 2004;23(14):2465-71. Přejít k původnímu zdroji...
  421. HASKÓ, G., and B. CRONSTEIN. Regulation of Inflammation by Adenosine. Front. Immunol. 2013;4:85. Přejít k původnímu zdroji...
  422. HASKÓ, G., J. LINDEN, B. CRONSTEIN, and P. PACHER. Adenosine receptors: therapeutic aspects for inflammatory and immune diseases. Nat. Rev. Drug Discov. 2008;7(9):759-70. Přejít k původnímu zdroji...
  423. HAUSER, A. S., S. CHAVALI, I. MASUHO, L. J. JAHN, K. A. MARTEMYANOV, D. E. GLORIAM, and M. M. BABU MM. Pharmacogenomics of GPCR Drug Targets. Cell. 2018;172(1-2):41-54.e19. Přejít k původnímu zdroji...
  424. MALO, N., J. A. HANLEY, S. CERQUOZZI, J. PELLETIER, and R. NADON. Statistical practice in high-throughput screening data analysis. Nat. Biotechnol. 2006;24(2):167-75. Přejít k původnímu zdroji...
  425. BUTTON, D., and M. BROWNSTEIN. Aequorin-expressing mammalian cell lines used to report Ca2+ mobilization. Cell Calcium. 1993;14(9):663-71. Přejít k původnímu zdroji...
  426. SHEU, Y. A., L. J. KRICKA, and D. B. PRITCHETT. Measurement of intracellular calcium using bioluminescent aequorin expressed in human cells. Anal. Biochem. 1993;209(2):343-7. Přejít k původnímu zdroji...
  427. LE POUL, E., S. HISADA, Y. MIZUGUCHI, V. J. DUPRIEZ, E. BURGEON, and M. DETHEUX. Adaptation of aequorin functional assay to high throughput screening. J. Biomol. Screen. 2002;7(1):57-65. Přejít k původnímu zdroji...
  428. GUNTER, B., C. BRIDEAU, B. PIKOUNIS, and A. LIAW. Statistical and Graphical Methods for Quality Control Determination of High-Throughput Screening Data. J. Biomol. Screen. 2003;8(6):624-33. Přejít k původnímu zdroji...
  429. SITTAMPALAM, G. S., N. P. COUSSENS, K. BRIMACOMBE, A. GROSSMAN, M. ARKIN, D. AULD, C. AUSTIN, J. BAELL, B. BEJCEK, J. M. M. CAAVEIRO, T. D. Y. CHUNG, J. L. DAHLIN, V. DEVANARYAN, T. L. FOLEY, M. GLICKSMAN, M. D. HALL, J. V. HAAS, J. INGLESE, P. W. IVERSEN, S. D. KAHL, S. C. KALES, M. LAL-NAG, Z. LI, J. MCGEE, O. MCMANUS, T. RISS, O. J. JR. TRASK, J. R. WEIDNER, M. J. WILDEY, M. XIA, and X. XU. Assay Guidance Manual. Assay Guidance Manual (Eli Lilly & Company and the National Center for Advancing Translational Sciences). 2004.
  430. SITTAMPALAM, G. S., N. P. COUSSENS, K. BRIMACOMBE, A. GROSSMAN, M. ARKIN, D. AULD, C. AUSTIN, J. BAELL, B. BEJCEK, J. M. M. CAAVEIRO, T. D. Y. CHUNG, J. L. DAHLIN, V. DEVANARYAN, T. L. FOLEY, M. GLICKSMAN, M. D. HALL, J. V. HAAS, J. INGLESE, P. W. IVERSEN, S. D. KAHL, S. C. KALES, M. LAL-NAG, Z. LI, J. MCGEE, O. MCMANUS, T. RISS, O. J. JR. TRASK, J. R. WEIDNER, M. J. WILDEY, M. XIA, and X. XU. New in Assay Guidance Manual. Assay Guidance Manual (Eli Lilly & Company and the National Center for Advancing Translational Sciences). 2017.
  431. BIRMINGHAM, A., L. M. SELFORS, T. FORSTER, D. WROBEL, C. J. KENNEDY, E. SHANKS, J. SANTOYO-LOPEZ, D. J. DUNICAN, A. LONG, D. KELLEHER, Q. SMITH, R. L. BEIJERSBERGEN, P. GHAZAL, and C. E. SHAMU. Statistical methods for analysis of high-throughput RNA interference screens. Nat. Methods. 2009;6(8):569-75. Přejít k původnímu zdroji...
  432. ANDREADIS, A. Misregulation of Tau Alternative Splicing in Neurodegeneration and Dementia. In: Alternative Splicing and Disease. Progress in Molecular and Subcellular Biology. Germany: Springer; 2006. pp.89-107. ISBN: 978-3-540-34449-0. Přejít k původnímu zdroji...
  433. LEE, G., N. COWAN, and M. KIRSCHNER. The primary structure and heterogeneity of tau protein from mouse brain. Science. 1988; 239(4837):285-288. Přejít k původnímu zdroji...
  434. MANDELKOW, E.-M. and E. MANDELKOW. Biochemistry and Cell Biology of Tau Protein in Neurofibrillary Degeneration. Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine. 2012; 2(7): a006247. Přejít k původnímu zdroji...
  435. PELLEGRINI, L., A. WETZEL, S. GRANNÓ, G. HEATON, and K. HARVEY. Back to the tubule: microtubule dynamics in Parkinson's disease. Cellular and Molecular Life Sciences. 2017; 74(3):409-434. Přejít k původnímu zdroji...
  436. GRUNDKE-IQBAL, I., K. IQBAL, M. QUINLAN, Y. C. TUNG, M. S. ZAIDI, and H. M. WISNIEWSKI. Microtubule-associated protein tau. A component of Alzheimer paired helical filaments. Journal of Biological Chemistry. 1986; 261(13):6084-6089. Přejít k původnímu zdroji...
  437. MUKRASCH, M. D., M. von BERGEN, J. BIERNAT, D. FISCHER, C. GRIESINGER, E. MANDELKOW, and M. ZWECKSTETTER. The "Jaws" of the Tau-Microtubule Interaction. Journal of Biological Chemistry. 2007; 282(16):12230-12239. Přejít k původnímu zdroji...
  438. GANGULY, P., T. D. DO, L. LARINI, N. E. LAPOINTE, A. J. SERCEL, M. F. SHADE, S. C. FEINSTEIN, M. T. BOWERS, and J. E. SHEA. Tau Assembly: The Dominant Role of PHF6 (VQIVYK) in Microtubule Binding Region Repeat R3. Journal of Physical Chemistry B. 2015; 119(13):4582-4593. Přejít k původnímu zdroji...
  439. ADAMCIK, J., A. SÁNCHEZ-FERRER, N. AIT-BOUZIAD, N. P. REYNOLDS, H. A. LASHUEL, and R. MEZZENGA. Microtubule-Binding R3 Fragment from Tau Self-Assembles into Giant Multistranded Amyloid Ribbons. Angewandte Chemie International Edition. 2016; 55(2):618-622. Přejít k původnímu zdroji...
  440. STÖHR, J., H. WU, M. NICK, Y. WU, M. BHATE, C. CONDELLO, N. JOHNSON, J. RODGERS, T. LEMMIN, S. ACHARYA, J. BECKER, K. ROBINSON, M. J. KELLY, F. GAI, G. STUBBS, S. B. PRUSINER, and W. F. DEGRADO. A 31-residue peptide induces aggregation of tau's microtubule-binding region in cells. Nature Chemistry. 2017; 9(9):874-881. Přejít k původnímu zdroji...
  441. ANNADURAI, N., A. CAGNOTTO, A. BASTONE, M. SALMONA, P. DŽUBÁK, M. HAJDÚCH, and V. DAS. Identification of potential inhibitors of tau aggregation for Alzheimer's disease therapy, Czech Chemical Society Symposium Series.2017; 15:3.
  442. EDDERSHAW, P.J., A.P. BERESFORD, and M.K. BAYLISS. ADME/PK as part of a rational approach to drug discovery. Drug Discovery Today. 2000; 5:409e14. Přejít k původnímu zdroji...
  443. LIN, J., D.C. SAHAKIAN, S.M. DE MORAIS, J.J. XU, R.J. POLZER, and S.M. WINTER. The role of absorption, distribution, metabolism, excretion and toxicity in drug discovery. Current Topics in Medicinal Chemistry. 2003; 3(10):1125-54. Přejít k původnímu zdroji...
  444. SMITH, D.A., L. DI, and E.H. KERNS. The effect of plasma protein binding on in vivo efficacy: misconceptions in drug discovery. Nature Reviews Drug Discovery. 2010; 9:929-39. Přejít k původnímu zdroji...
  445. NASSAR, A.F., P.F. HOLLENBERG, and J. SCATINA. Drug metabolism handbook: concepts and applications. Hoboken NJ: Wiley; 2009. ISBN: 9780470118030. Přejít k původnímu zdroji...
  446. KWON, Y. Handbook of essential pharmacokinetics, pharmacodynamics, and drug metabolism for industrial scientists. New York: Kluwer Academic/Plenum Publishers; 2001. ISBN: 9780306468209.
  447. MACARRON, R., M.N. BANKS, D. BOJANIC, D.J. BURNS, D.A. CIROVIC, T. GARYANTES, D. V. S. GREEN, R. P. HERTZBERG, W. P. JANZEN, J. W. PASLAY, U. SCHOPFER, and G.. S. SITTAMPALAM. Impact of high-throughput screening in biomedical research. Nature Reviews Drug Discovery. 2011; 10:188-95. Přejít k původnímu zdroji...
  448. KERNS, E.H., L. DI. Chemical Stability. In: Comprehensive Medicinal Chemistry II. Amsterdam, London: Elsevier; 2007. pp. 489-507. ISBN: 9780080450445 Přejít k původnímu zdroji...
  449. DI, L., E.H. KERNS, Y. HONG, and S.L. PETUSKY. Development and Application of an Automated Solution Stability Assay for Drug Discovery. Journal of Biomolecular Screening. 2006; 11(1):40-47. Přejít k původnímu zdroji...
  450. DI, L., E.H. KERNS, Y. HONG, and H. CHEN. Development and Application of High Throughput Plasma Stability Assay for Drug Discovery. International Journal of Pharmaceutics. 2005; 297(1-2):110-119. Přejít k původnímu zdroji...
  451. SONG, H., G.W. GRIESGRABER, C.R. WAGNER, and C.L. ZIMMERMAN. Pharmacokinetics of Amino Acid Phosphoramidate Monoesters of Zidovudine in Rats. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2002; 46(5):1357-1363. Přejít k původnímu zdroji...
  452. DI, L., E.H. KERNS, X.J. MA, Y. HUANF, and G.T. CARTER. Applications of High Throughput Microsomal Stability Assay in Drug Discovery. Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. 2008; 11:469-476. Přejít k původnímu zdroji...
  453. PHILLIPS, I.R, E.A. SHEPHARD, and P.R. ORTIZ DE MONTELLANO. Cytochrome P450 protocols. Totowa: Springer; 2013. ISBN: 9781627033206. Přejít k původnímu zdroji...
  454. WU, X., J. WANG, L. TAN, J. BUI, E. GJERSTAD, K. MCMILLAN, and W. ZHANG. In vitro ADME profiling using high-throughput Rapidfire mass spectrometry: cytochrome P450 inhibition and metabolic stability assays. Journal of Biomolecular Screening. 2012; 17(6):761-72. Přejít k původnímu zdroji...
  455. TRAINOR, G.L. The importance of plasma protein binding in drug discovery. Expert Opinion on Drug Discovery. 2007; 2(1):51-64. Přejít k původnímu zdroji...
  456. YE, Z., C. ZETTERBERG, and H. GAO. Automation of plasma protein binding assay using rapid equilibrium dialysis device and Tecan workstation. Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 2017; 140:210-214. Přejít k původnímu zdroji...
  457. VAN LIEMPD, S., D. MORRISON, L. SYSMANS, P. NELIS, and R. MORTISHIR-SMITH. Development and validation of a higher-throughput equilibrium dialysis assay for plasma protein binding. Journal of laboratory automation. 2011; 16(1):56-67. Přejít k původnímu zdroji...
  458. AVDEEF, A., P. ARTURSSON, S. NEUHOFF, L. LAZOROVA, J. GRASJO, and S. TAVELIN. Caco-2 permeability of weakly basic drugs predicted with the double-sink PAMPA pKa(flux) method. European Journal of Pharmaceutical Sciences. 2005; 24: 333-49. Přejít k původnímu zdroji...
  459. VOLPE, DA. Drug-permeability and transporter assays in Caco-2 and MDCK cell lines. Future Medicinal Chemistry. 2011; 3:2063-77. Přejít k původnímu zdroji...
  460. FENG, B., J.B. MILLS, R.E. DAVIDSON, R.J. MIRELES, J.S. JANISZEWSKI, M.D. TROUTMAN, and S.M. DE MORAIS. In vitro p-glycoprotein assays to predict the in vivo interactions of p-glycoprotein with drugs in the central nervous system. Drug Metabolism and Disposition. 2008; 36:268-275. Přejít k původnímu zdroji...
  461. FAN, J. and I.A. DE LANNOY. Pharmacokinetics. Biochemical Pharmacology. 2014; 87:93-120. Přejít k původnímu zdroji...
  462. http://www.corning.com/catalog/cls/documents/protocols/Transwell_InstructionManual.pdf
  463. TOKARENKO, A., B. LISKOVA, S. SMOLEN, N. TABORSKA, M. TICHY, S. GURSKA, P. PERLIKOVA, I. FRYDRYCH, E. TLOUST'OVA, P. ZNOJEK, H. MERTLIKOVA-KAISEROVA, L. P. SLAVETINSKA, R. POHL, B. KLEPETAROVA, N. U. A. KHALID, Y. Q. WENREN, R. R. LAPOSA, P. DZUBAK, M. HAJDUCH, and M. HOCEK. Synthesis and cytotoxic and antiviral profiling of pyrrolo- and furo-fused 7-deazapurine ribonucleosides. Journal of Medicinal Chemistry. 2018;61(20):9347-9359. Přejít k původnímu zdroji...
  464. SKOLNIK, S., X. LIN, J. WANG, X.H. CHEN, T. HE, and B. ZHANG. Towards prediction of in vivo intestinal absorption using a 96-well Caco-2 assay. Journal of Pharmaceutical Sciences. 2009;99:3246-65. Přejít k původnímu zdroji...
  465. Wolff, A.C., M.E.H. Hammond, K.H. Allison, B.E. Harvey, L.M. McShane, and M. Dowsett. HER2 Testing in Breast Cancer: American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists Clinical Practice Guideline Focused Update Summary. J Oncol Pract. 2018; 14(7):437-441. Přejít k původnímu zdroji...
  466. Koudelakova, V., J. Berkovcova, R. Trojanec, J. Vrbkova, L. Radova, J. Ehrmann, Z. kolar, B. MELICHAR, and m. hajduch. Evaluation of HER2 gene status in breast cancer samples with indeterminate fluorescence in situ hybridization by quantitative real-time PCR. J Mol Diagnostics. 2015; 17(4):446-55. Přejít k původnímu zdroji...
  467. Ross, J.S., J.A. Fletcher, K.J. Bloom, G.P. Linette, J. Stec, E. Clark, M. Ayers, W.F. Symmans, L. Pusztai, and G.N. HORTOBAGYI. HER-2/neu Testing in Breast Cancer. Pathol Patterns Rev. 2003; 120:S53-71. Přejít k původnímu zdroji...
  468. Müller, B.M., R. Kronenwett, G. Hennig, H. Euting, K. Weber, K. Bohmann, W. Weichert, G. Altmann, C. Roth, K.J. Winzer, G. Kristiansen, C. Petry, M. Dietel, and C. DENKERT. Quantitative determination of estrogen receptor, progesterone receptor, and HER2 mRNA in formalin-fixed paraffin-embedded tissue-a new option for predictive biomarker assessment in breast cancer. Diagn Mol Pathol. 2011; 20(1):1-10. Přejít k původnímu zdroji...
  469. Khoury T. Delay to Formalin Fixation (Cold Ischemia Time) Effect on Breast Cancer Molecules. Am J Clin Pathol. 2018; 149(4):275-292. Přejít k původnímu zdroji...
  470. SAIKI, R. K., S. SCHARF, F. FALOONA, K. B. MULLIS, G. T. HORN, H. A. ERLICH, and N. ARNHEIM. Enzymatic amplification of beta-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia. Science, 1985, 230(4732), 1350-1354. Přejít k původnímu zdroji...
  471. HUTCHISON, C. A., S. PHILLIPS, M. H. EDGELL, S. GILLAM, P. JAHNKE, and M. SMITH. Mutagenesis at a specific position in a DNA sequence. Journal of Biological Chemistry, 1978, 253(18), 6551-6560. Přejít k původnímu zdroji...
  472. XIA, Y. Z., W. Q. CHU, Q. S. QI, and L. Y. XUN. New insights into the QuikChange (TM) process guide the use of Phusion DNA polymerase for site-directed mutagenesis. Nucleic Acids Research, 2015, 43(2), Přejít k původnímu zdroji...
  473. MACEK, M., M. MACEK, J. L. SERRE, V. VAVROVA, J. BURGER, A. REIS, J. SCHMIDTKE, K. SPERLING, and G. CUTTING. Population Study of CFTR Gene-Mutations in Bohemia and Moravia - Hypothesis on the Historical Spread of G551D and Deltaf508 in Europe. American Journal of Human Genetics, 1991, 49(4), 474-474.
  474. KRENKOVA, P., T. PISKACKOVA, A. HOLUBOVA, M. BALASCAKOVA, V. KRULISOVA, J. CAMAJOVA, M. TURNOVEC, M. LIBIK, P. NORAMBUENA, A. STAMBERGOVA, L. DVORAKOVA, V. SKALICKA, J. BARTOSOVA, T. KUCEROVA, L. FILA, D. ZEMKOVA, V. VAVROVA, M. KOUDOVA, M. MACEK, A. KREBSOVA, and M. MACEK. Distribution of CFTR mutations in the Czech population: Positive impact of integrated clinical and laboratory expertise, detection of novel/de novo alleles and relevance for related/derived populations. Journal of Cystic Fibrosis, 2013, 12(5), 532-537.
  475. RATJEN, F. and E. TULLIS. Airway diseases. Cystic fibrosis. In: SPIRO, S. G., SILVESTRI, G. A., and AGUSTI, A. Clinical Respiratory MedicineElsevier, 2012, p. 568-579. 978-1-4557-0792-8. Přejít k původnímu zdroji...
  476. BRENNAN, M. L. and I. SCHRIJVER. Cystic Fibrosis A Review of Associated Phenotypes, Use of Molecular Diagnostic Approaches, Genetic Characteristics, Progress, and Dilemmas. Journal of Molecular Diagnostics, 2016, 18(1), 3-14. Přejít k původnímu zdroji...
  477. BAYES, T. Essay towards solving a problem in the doctrine of chances. Philosophical Transactions of the Royal Society London, B Biological Sciences, 1763, 53(370-418). Přejít k původnímu zdroji...
  478. BONKE, B., A. TIBBEN, D. LINDHOUT, A. J. CLARKE, and T. STIJNEN. Genetic risk estimation by healthcare professionals. Medical Journal of Australia, 2005, 182(3), 116-118. Přejít k původnímu zdroji...
  479. OGINO, S., R. B. WILSON, and W. W. GRODY. Bayesian risk assessment for autosomal recessive diseases: fetal echogenic bowel with one or no detectable CFTR mutation. Journal of Medical Genetics, 2004, 41(5), e70. Přejít k původnímu zdroji...
  480. OGINO, S., R. B. WILSON, B. GOLD, P. HAWLEY, and W. W. GRODY. Bayesian analysis for cystic fibrosis risks in prenatal and carrier screening. Genetics in Medicine, 2004, 6(5), 439-449. Přejít k původnímu zdroji...
  481. COWEL, R. G., P. DAWID, S. L. LAURITZEN, and D. J. SPIEGELHALTER. Probabilistic Networks and Expert Systems: Exact Computational Methods for Bayesian Networks.Springer, 2007. 336 p. ISBN: 978-0387987675.
  482. ESSEN-MOLLER, E. Die Beweiskraft der Ahnlichkeit im Vaterschaftsnachweis - Theoretische Grundlagen [The evidential value of similarity as proof of paternity, fundamental principles]. Mitteilungen der Anthropologischen Gesellschaft, 1938, 68(9-53).
  483. PAGIN, A., A. DEVOS, M. FIGEAC, M. TRUANT, C. WILLOQUAUX, F. BROLY, and G. LALAU. Applicability and Efficiency of NGS in Routine Diagnosis: In-Depth Performance Analysis of a Complete Workflow for CFTR Mutation Analysis. PLoS ONE, 2016, 11(2), e0149426. Přejít k původnímu zdroji...
  484. IVANOV, M., A. MATSVAY, O. GLAZOVA, S. KRASOVSKIY, M. USACHEVA, E. AMELINA, A. CHERNYAK, M. IVANOV, S. MUSIENKO, T. PRODANOV, S. KOVALENKO, A. BARANOVA, and K. KHAFIZOV. Targeted sequencing reveals complex, phenotype-correlated genotypes in cystic fibrosis. BMC Medical Genomics, 2018, 11(Suppl.), 13-13. Přejít k původnímu zdroji...
  485. ORMOND, K. E., M. Y. LAURINO, K. BARLOW-STEWART, T. M. WESSELS, S. MACAULAY, J. AUSTIN, and A. MIDDLETON. Genetic counseling globally: Where are we now? American Journal of Medical Genetics Part C-Seminars in Medical Genetics, 2018, 178(1), 98-107. Přejít k původnímu zdroji...
  486. STARK, A. and G. MORGAN. Use of Bayes' Formula to Make a Genetic Risk Estimate. Twin Research and Human Genetics, 2011, 14(4), 340-342. Přejít k původnímu zdroji...
  487. OGINO, S., P. FLODMAN, R. B. WILSON, B. GOLD, and W. W. GRODY. Risk calculations for cystic fibrosis in neonatal screening by immunoreactive trypsinogen and CFTR mutation tests. Genetics in medicine : official journal of the American College of Medical Genetics, 2005, 7(5), 317-327. Přejít k původnímu zdroji...
  488. SHIFMAN, M.I. and D.G. STEIN. A reliable and sensitive method for non-radioactive Northern blot analysis of nerve growth factor mRNA from brain tissues. J Neurosci Methods. 1995 Jul;59(2):205-8. Přejít k původnímu zdroji...
  489. PRITCHAR C.C., H.H. CHENG, and M. TEWARI. MicroRNA profiling: approaches and considerations. Nature Reviews. Genetics. 2012; 13(5):358-369. Přejít k původnímu zdroji...
  490. Thermofisher.com. 2019 [cited 15 May 2019]. Available from: https://tools.thermofisher.com/content/sfs/brochures/miRNA_4-0_and_4-1_datasheet.pdf
  491. Thermofisher.com. 2019 [cited 15 May 2019]. Available from: https://media.affymetrix.com/support/downloads/manuals/mirna_flashtag_manual.pdf
  492. MILLNER L. Circulating Tumour Cells: A Review of Present Methods and the Need to Identify Heterogeneous Phenotypes. Ann Clin Lab Sci. 2013; 43(3):295-304.
  493. Tools.thermofisher.com. 2018 [cited 22 December 2018]. Available from: http://tools.thermofisher.com/content/sfs/manuals/trizol_reagent.pdf
  494. Gene Expression | Quantitation Troubleshooting | Thermofisher.com. 2018 [cited 22 December 2018]. Available from: https://www.thermofisher.com/cz/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/real-time-pcr-learning-center/real-time-pcr-basics/real-time-pcr-troubleshooting-tool/gene-expression-quantitation-troubleshooting.html
  495. LI, W. and M. OLIVIER. Current analysis platforms and methods for detecting copy number variation. Physiol Genomics. 2013 Jan; 45(1):1-16. Přejít k původnímu zdroji...
  496. FREDMAN, D., S.J. WHITE, S. POTTER, E.E. EICHLER, J.T. DEN DUNNEN, and A.J. BROOKES. Complex SNP-related sequence variation in segmental genome duplications. Nat Genet. 2004 Aug;36(8):861-6. Přejít k původnímu zdroji...
  497. STANKIEWICZ, P. and J.R. LUPSKI. Structural variation in the human genome and its role in disease. Annu Rev Med. 2010;61:437-455. Přejít k původnímu zdroji...
  498. DISKIN, S.J., C. HOU, J.T. GLESSNER, E.F. ATTIYEH, M. LAUDENSLAGER, and K. BOSSE. Copy number variation at 1q21.1 associated with neuroblastoma. Nature. 2009 Jun;459(7249):987-991. Přejít k původnímu zdroji...
  499. SEBAT, J., B. LAKSHMI, D. MALHOTRA, J. TROGE, C. LESE-MARTIN, and T. WALSH. Strong association of de novo copy number mutations with autism. Science. 2007 Apr;316(5823):445-449. Přejít k původnímu zdroji...
  500. AITMAN, T., R. DONG, T. VYSE, P. NORSWORTHY, M. JOHNSON, and J. SMITH. Copy number polymorphism in Fcgr3 predisposes to glomerulonephritis in rats and humans. Nature. 2006 Feb;439(7078):851-855. Přejít k původnímu zdroji...
  501. COOK, Jr. E.H. and S.W. SCHERER. Copy-number variations associated with neuropsychiatric conditions. Nature. 2008 Oct;455(7215):919-923. Přejít k původnímu zdroji...
  502. GONZALES, E., H. KULKARNI, H. BOLIVAR, A. MANGANO, R. SANCHEZ, and G. CATANO. The influence of CCL3L1 gene-containing segmental duplications on HIV-1/AIDS susceptibility. Science. 2005 Mar;307(5714):1434-1440. Přejít k původnímu zdroji...
  503. LI, S., X. DOU, G. GAO, X. GE. M. QIAN, and L. WAN. A remark on copy number variation detection methods. PLoS One. 2018 Apr;13(4):e0196226. Přejít k původnímu zdroji...
  504. GRESHAM, D., M.J. DUNHAM, and D. BOTSTEIN. Comparing whole genomes using DNA microarrays. Nat Rev Genet. 2008 Apr;9(4):291-302. Přejít k původnímu zdroji...
  505. CARTER, N.P. Methods and strategies for analyzing copy number variation using DNA microarrays. Nat Genet. 2007 Jul;39:S16-21. Přejít k původnímu zdroji...
  506. WANG, Y., M. MOORHEAD, G. KARLIN-NEUMANN, M. FALKOWSKI, C. CHEN, and F. SIDDIQUI. Allele quantification using molecular inversion probes (MIP). Nucleic Acids Res. 2005 Nov;33(21):e183. Přejít k původnímu zdroji...
  507. COUGHLIN, II C.R., G.H. SCHARER, and T.H. SHAIKH. Clinical impact of copy number variation analysis using high-resolution microarray technologies: advantages, limitations and concerns. Genome Med. 2012 Oct;4(10):80. Přejít k původnímu zdroji...
  508. LIANG, C.W., Y.S LEE, A. MARINO-ENRIQUEZ, K. TSUI, and S.H. HUANG. The utility and limitation of single nucleotide polymorphism analysis on whole genome amplified mesenchymal tumour DNA in formalin fixed tumour samples. Pathology. 2012 Jan;44(1):33-41. Přejít k původnímu zdroji...
  509. KRIJGSMAN, O., D. ISRAELI, J.C. HAAN, H.F. VAN ESSEN, S.J. SMEETS, and P.P. EIJK. CGH arrays compared for DNA isolated from formalin-fixed, paraffin-embedded material. Genes Chromosomes Cancer. 2012 Apr;51(4):344-52. Přejít k původnímu zdroji...
  510. WANG, Y., M. COTTMAN, and J.D. SCHIFFMAN. Molecular inversion probes: a novel microarray technology and its application in cancer research. Cancer Genet. 2012 Jul-Aug;205(7-8):341-55. Přejít k původnímu zdroji...
  511. FOSTER, J.M, A. OUMIE, F.S. TOGNERI, F.R. VASQUEZ, D. HAU, and M. TAYLOR. Cross-laboratory validation of the OncoScan FFPE assay, a multiplex tool for whole genome tumour profiling. BMC Med Genomics. 2015 Feb;8:5. Přejít k původnímu zdroji...
  512. ThermoFisher Scientific [Internet]. Affymetrix, 2015. OncoScan CNV FFPE Assay Kit User Guide cit. 7.12.2018. Available from: https://www.thermofisher.com/document-connect/document-connect.html?url=https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/oncoscan_cnv_assay_userguide.pdf.
  513. ThermoFisher Scientific [Internet]. Affymetrix, 2013. OncoScan FFPE Assay Kit User Guide cit. 7.12.2018. Available from: https://www.thermofisher.com/document-connect/document-connect.html?url=https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/oncoscan_assay_manual.pdf
  514. ThermoFisher Scientific [Internet]. Affymetrix, 2015. OncoScan Console 1.3 User Guide cit. 7.12.2018. Available from: https://www.thermofisher.com/document-connect/document-connect.html?url=https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/oncoscan_console_user_guide.pdf
  515. QIAxcel Advanced Application Guide. Qiagen, 10/2016, available online (https://www.qiagen.com/us/resources/resourcedetail?id=0247e097-450c-4c2a-93fe-7cf144e4d281〈=en)
  516. FERRIS, M., Performance Assessment of DNA Fragment Sizing by High-Sensitivity Flow Cytometry and Pulsed-Field Gel Electrophoresis. Journal of Clinical Microbiology. 2004; 42(5):1965-1976 Přejít k původnímu zdroji...
  517. LEE, PY., Agarose Gel Electrophoresis for the Separation of DNA Fragments. Journal of Visualized Experiments. 2012; (62):3923 Přejít k původnímu zdroji...
  518. Klouda, p., Moderní analytické metody. Druhé vydání. Ostrava: Nakladatelství Pavel Klouda; 2003. ISBN: 80-86369-07-2
  519. Drábek, j., Detekce nádorových biomarkerů v molekulárně biologické laboratoři. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci; 2012. ISBN: 978-80-244-3199-4
  520. QIAxcel Advanced User Manual. Qiagen, 11/2017, HB-0804-010, available online (https://www.qiagen.com/at/resources/resourcedetail?id=e3edf734-1e5a-4ebf-957e-a35e120d6290〈=en)
  521. LI, E. and Y. ZHANG. DNA methylation in mammals. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2014; 6(5):a019133. Přejít k původnímu zdroji...
  522. LI, L. C., and R. DAHIYA. MethPrimer: designing primers for methylation PCRs. Bioinformatics. 2002; 18(11):1427-1431. Přejít k původnímu zdroji...
  523. ZYMORESEARCH. EZ DNA Methylation-Gold™ Kit Instruction manual [internet]. [Available from: https://www.zymoresearch.eu/media/amasty/amfile/attach/_D5005_D5006_EZ_DNA_Methylation-GoldGa_o_Kit_REVISED.pdf].
  524. ILLUMINA. Nextera XT DNA Library Prep Kit Reference Guide [internet]. [Available from: https://support.illumina.com/content/dam/illumina-support/documents/documentation/chemistry_documentation/samplepreps_nextera/nextera-xt/nextera-xt-library-prep-reference-guide-15031942-03.pdf].
  525. KRUEGER, F. and S. R. ANDREWS. Bismark: a flexible aligner and methylation caller for Bisulfite-Seq applications. Bioinformatics. 2011; 27(11):1571-1572. Přejít k původnímu zdroji...
  526. GRANA, O., H. LOPEZ-FERNANDEZ, F. FDEZ-RIVEROLA, D. GONZALEZ PISANO, and D. GLEZ-PENA. Bicycle: a bioinformatics pipeline to analyze bisulfite sequencing data. Bioinformatics. 2018; 34(8):1414-1415. Přejít k původnímu zdroji...
  527. AKALIN, A., M. KORMAKSSON, S. LI, F. E. GARRETT-BAKELMAN, M. E. FIGUEROA, A. MELNICK, and C. E. MASON. methylKit: a comprehensive R package for the analysis of genome-wide DNA methylation profiles. Genome Biology. 2012; 13(10):R87. Přejít k původnímu zdroji...
  528. MERKEL, A., M. FERNANDEZ-CALLEJO, E. CASALS, S. MARCO-SOLA, R. SCHUYLER, I. G. GUT, and S. C. HEATH. gemBS: high throughput processing for DNA methylation data from bisulfite sequencing. Bioinformatics. 2019; 35(5):737-742. Přejít k původnímu zdroji...
  529. Qiagen [Internet]. Qiagen, 2009. PyroMark PCR Handbook [cit. 14.12.2018]. Available from: https://www.qiagen.com/fi/resources/resourcedetail?id=b8cdb9f4-c1ec-4045-83dd-468f4bf5b8fa〈=en. 2019; Qiagen [Internet].
  530. Qiagen, 2012. EpiTect Fast Bisulfite Conversion Handbook [cit. 12.12.2018]. Available from: https://www.qiagen.com/us/resources/resourcedetail?id=15863f2d-9d1c-4f12-b2e8-a0c6a82b2b1e〈=en. 2019;
  531. Qiagen [Internet]. Qiagen, 2016. PyroMark Q48 Autoprep User Manual [cit. 17.12.2018]. Available from: https://www.qiagen.com/nl/resources/resourcedetail?id=650a0c13-3b8e-4a77-b433-6b1e50b9525a〈=en. 2019; Qiagen [Internet].
  532. Qiagen, 2018. QIAcube User Manual [cit. 14.12.2018]. Available from: https://www.qiagen.com/fi/resources/resourcedetail?id=f7d77c6e-0479-4b2b-a2e0-5ca747114e34〈=en. 2019
  533. BOCKLANDT, S., W. LIN, M. E. SEHL, F. J. SANCHEZ, J. S. SINSHEIMER, S. HORVATH, and E. VILAIN. Epigenetic Predictor of Age. PLoS ONE, 2011, 6(6) Přejít k původnímu zdroji...
  534. HORVATH, S. DNA methylation age of human tissues and cell types. Genome Biol, 2013, 14(10), R115 Přejít k původnímu zdroji...
  535. JUNG, S. E., S. M. LIM, S. R. HONG, E. H. LEE, K. J. SHIN, and H. Y. LEE. DNA methylation of the ELOVL2, FHL2, KLF14, C1orf132/MIR29B2C, and TRIM59 genes for age prediction from blood, saliva, and buccal swab samples. Forensic Science International-Genetics, 2019, 38(1-8. Přejít k původnímu zdroji...
  536. LOPEZ-OTIN, C., M. A. BLASCO, L. PARTRIDGE, M. SERRANO, and G. KROEMER. The Hallmarks of Aging. Cell, 2013, 153(6), 1194-1217. Přejít k původnímu zdroji...
  537. MARIONI, R. E., S. SHAH, A. F. MCRAE, B. H. CHEN, E. COLICINO, S. E. HARRIS, J. GIBSON, A. K. HENDERS, P. REDMOND, S. R. COX, A. PATTIE, J. CORLEY, L. MURPHY, N. G. MARTIN, G. W. MONTGOMERY, A. P. FEINBERG, M. D. FALLIN, M. L. MULTHAUP, A. E. JAFFE, R. JOEHANES, J. SCHWARTZ, A. C. JUST, K. L. LUNETTA, J. M. MURABITO, J. M. STARR, S. HORVATH, A. A. BACCARELLI, D. LEVY, P. M. VISSCHER, N. R. WRAY, and I. J. DEARY, DNA methylation age of blood predicts all-cause mortality in later life. Genome Biol., 2015, 16(25 Přejít k původnímu zdroji...
  538. MEISSNER, C. and S. RITZ-TIMME. Molecular pathology and age estimation. Forensic Science International, 2010, 203(1-3), 34-43. Přejít k původnímu zdroji...
  539. WEIDNER, C. I., Q. LIN, C. M. KOCH, L. EISELE, F. BEIER, P. ZIEGLER, D. O. BAUERSCHLAG, K. H. JOCKEL, R. ERBEL, T. W. MUHLEISEN, M. ZENKE, T. H. BRUMMENDORF, and W. WAGNER. Aging of blood can be tracked by DNA methylation changes at just three CpG sites. Genome Biology, 2014, 15(2) Přejít k původnímu zdroji...
  540. ZBIEC-PIEKARSKA, R., M. SPOLNICKA, T. KUPIEC, A. PARYS-PROSZEK, Z. MAKOWSKA, A. PALECZKA, K. KUCHARCZYK, R. PLOSKI, and W. BRANICKI. Development of a forensically useful age prediction method based on DNA methylation analysis. Forensic Science International: Genetics, 2015, 17(173-179. Přejít k původnímu zdroji...